Whole-genome genotyping of residual populations of Pulsatilla patens, Dracocephalum austriacum and Campanula cervicaria, critically endangered plant species of the Czech Republic
Project goals
The project aims to determine the populations' genetic structure and the level of genetic diversity of three critically endangered plant species of the Czech Republic. These species are 1) actively protected in the CZ by Action Plans; 2) protected within the EU; 3) dramatically disappearing at both number of localities and number of individuals (Pulsatilla patens - meets points 1,2,3; Dracocephalum austriacum - 1, 2; Campanula cervicaria - 3). The main output of the project will be a certified method of identification of evolutionarily significantt units (ESU) of endangered plant species using whole-genome genotyping with DArTSeq markers, as a tool for effective planning of monitoring and practical protection of endangered species in the Czech Republic by population-genomic approaches.
Keywords
genetic-diversitycritically-endangered-speciesrare-plantsDArTseqbiodiversityEvolutionarily-Significant-Unitadaptive-potential-of-species
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
—
Call for proposals
Prostředí pro život 5 (STA02022SS050)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
SS05010116 - Smlouva o poskytnutí podpory
Alternative language
Project name in Czech
Celogenomové genotypování zbytkových populací Pulsatilla patens, Dracocephalum austriacum a Campanula cervicaria, kriticky ohrožených druhů rostlin České republiky
Annotation in Czech
Projekt vychází z aktuálního požadavku aplikačního garanta (AOPK ČR) zjistit populačně genetickou strukturu a úroveň genetické diverzity ve zbývajících populacích tří kriticky ohrožených druhů rostlin České republiky. Tyto druhy jsou 1) aktivně chráněné v ČR Záchrannými programy; 2) prioritně chráněné v rámci EU; 3) dramaticky mizející na úrovni lokalit i jedinců (Pulsatilla patens – splňuje body 1,2,3; Dracocephalum austriacum – 1, 2; Campanula cervicaria - 3). Hlavním výstupem projektu bude certifikovaná metoda identifikace evolučně významných jednotek (ESU) ohrožených druhů rostlin pomocí celogenomového genotypování DArTSeq markery, využitelná pro efektivní plánování monitoringu a praktické ochrany ohrožených druhů v České republice populačně-genomickými přístupy.
Scientific branches
R&D category
AP - Applied research
OECD FORD - main branch
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - secondary branch
10619 - Biodiversity conservation
OECD FORD - another secondary branch
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
EB - Genetics and molecular biology
EF - Botany
EH - Ecology - communities
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2022
Realization period - end
Feb 28, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 28, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP25-TA0-SS-R
Data delivery date
Feb 20, 2025
Finance
Total approved costs
3,804 thou. CZK
Public financial support
3,234 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
571 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
3 804 CZK thou.
Public support
3 234 CZK thou.
85%
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
OECD FORD
Plant sciences, botany
Solution period
01. 03. 2022 - 28. 02. 2025