Transforming RDF Interoperability with Solid Pods for next Level Experience
Project goals
TRIPLE will bring existing and future RDF resources to a broader group of researchers by developing innovative solutions on four fronts: 1) We will store private (unpublished) data in Solid Pods, an emerging technology enabling decentralised private vaults to host private RDF data. 2) We will optimise federated queries spanning public and private SPARQL endpoints allowing users to query multiple resources from within their Solid Pod. 3) We will adapt state-of-the-art RDF documentation tools and make them available for all SPARQL endpoints, including Solid Pods. 4) We will develop data model visualisation, sets of standardised federated queries, and advanced query analysis and evaluation tools to help new users understand the data sources and run efficient federated queries. Finally, a demonstrator will show the impact of these advances when applied to a technically challenging use case of scientific relevance: the search for suitable organisms for bioremediation.
Keywords
bioinformaticsbiological databasesbioremediationdata integrationfederated dataRDFSolid PodsSPARQL
Public support
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
Programme
Programme of applied research and experimental development EPSILON
Call for proposals
—
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
TH86010003 - Smlouva o poskytnutí podpory
Alternative language
Project name in Czech
Výrazné zvýšení interoperability RDF se Solid Pody
Annotation in Czech
Cílem projektu je rozšířit stávající i budoucí RDF zdroje mezi širší vědeckou komunitu. Toho bude dosaženo vývojem inovativních řešení ve čtyřech oblastech: 1) Umožníme uložit soukromá (nepublikovaná) data do Solid Podů, nově vznikající technologie umožňující decentralizovaným soukromým úložištím hostovat soukromá RDF data. 2) Optimalizujeme federované dotazy zahrnující veřejné i soukromé koncové body, což umožní uživatelům dotazovat se více zdrojů z jejich Solid Podu. 3) Adaptujeme nejmodernější RDF dokumentační nástroje a zpřístupníme je pro všechny koncové body, včetně Solid Podů. 4) Vyvineme vizualizaci datového modelu, sady standardizovaných federovaných dotazů a pokročilé nástroje pro analýzu a vyhodnocování dotazů, které pomohou novým uživatelům porozumět zdrojům dat a efektivně spouštět federované dotazy. Užitečnost těchto nástrojů budeme demonstrovat na technicky náročném a vědecky relevantním příkladu: hledání vhodných organismů pro bioremediaci.
Scientific branches
R&D category
VV - Exeperimental development
OECD FORD - main branch
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
AF - Documentation, librarianship, work with information
BC - Theory and management systems
BD - Information theory
IN - Informatics
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2023
Realization period - end
Sep 30, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Feb 28, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Data delivery code
CEP24-TA0-TH-R
Data delivery date
Feb 22, 2024
Finance
Total approved costs
2,761 thou. CZK
Public financial support
2,347 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
414 thou. CZK
Recognised costs
2 761 CZK thou.
Public support
2 347 CZK thou.
0%
Provider
Technology Agency of the Czech Republic
OECD FORD
Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Solution period
01. 10. 2023 - 30. 09. 2025