Genetic diversity of the European oat crown rust (Puccinia coronata f. sp. avenae) isolates determined by AFLP analysis

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F06%3A1287" target="_blank" >RIV/00027006:_____/06:1287 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Stanovení genetické diverzity evropských izolátů rzi ovesné (Puccinia coronata f. sp. avenae) pomocí AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)

Original language description

Rez ovesná (Puccinia coronata f. sp. avenae) je považována za jednu z nejvýznamnějších listových houbových chorob každoročně napadající porosty ovsa (Avena sp.) ve většině světových oblastech jeho pěstování. Detailní poznání patogena je důležitou součástí šlechtitelských programů na rezistenci k obilním rzím. Celkem 40 monopustulových izolátů rzi ovesné, pocházejících z rozdílných geografických oblastí Evropy a Středního východu, bylo charakterizováno pomocí fytopatologické analýzy a molekulárně biologické metody AFLP. Byla zjištěna vysoká úroveň variability v rozsahu a kombinacích virulence u rzi ovesné, většina patotypů byla zjištěna pouze v individuálních případech. AFLP analýza byla provedena dle protokolu firmy Applied Biosystems. Každý z 12 primerových párů použitých v selektivní amplifikaci detekoval 13-58 DNA fragmentů v rozmezí 50-495 bp. Celkově bylo detekováno 501 polymorfních fragmentů u všech izolátů, což odpovídá průměrnému počtu 41 polymorfních fragmentů na primerový pár

Czech name

Stanovení genetické diverzity evropských izolátů rzi ovesné (Puccinia coronata f. sp. avenae) pomocí AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)

Czech description

Rez ovesná (Puccinia coronata f. sp. avenae) je považována za jednu z nejvýznamnějších listových houbových chorob každoročně napadající porosty ovsa (Avena sp.) ve většině světových oblastech jeho pěstování. Detailní poznání patogena je důležitou součástí šlechtitelských programů na rezistenci k obilním rzím. Celkem 40 monopustulových izolátů rzi ovesné, pocházejících z rozdílných geografických oblastí Evropy a Středního východu, bylo charakterizováno pomocí fytopatologické analýzy a molekulárně biologické metody AFLP. Byla zjištěna vysoká úroveň variability v rozsahu a kombinacích virulence u rzi ovesné, většina patotypů byla zjištěna pouze v individuálních případech. AFLP analýza byla provedena dle protokolu firmy Applied Biosystems. Každý z 12 primerových párů použitých v selektivní amplifikaci detekoval 13-58 DNA fragmentů v rozmezí 50-495 bp. Celkově bylo detekováno 501 polymorfních fragmentů u všech izolátů, což odpovídá průměrnému počtu 41 polymorfních fragmentů na primerový pár

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/1G58083" target="_blank" >1G58083: Sources of resistance and resistance selection methods for complex resistance breeding to main leaf diseases of wheat.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Sborník příspěvků z XVII. české a slovenské konference o ochraně rostlin

ISBN

80-213-1564-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

5

Pages from-to

243-247

Publisher name

Česká zemědělská univerzita Praha

Place of publication

ČZU Praha

Event location

Česká zemědělská univerzita Praha

Event date

Sep 12, 2006

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—