Genetic resources of barley and oat characterised by microsatellites

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F07%3A2035" target="_blank" >RIV/00027006:_____/07:2035 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Genetic resources of barley and oat characterised by microsatellites

Original language description

Barley (Hordeum vulgare L.) and oat (Avena sativa L.) are important crop species. 1865 accessions of winter barley, 2707 accessions of spring barley and 1998 accessions of oat are hold in RICP Gene bank. Expert core collection is used to be established as tool for germplasm study, conservation of genetic variability and for the identification of useful genes. The main aim of this was to evaluate genetic diversity of barley and oat genotypes within the expert core collections. Genetic variation of 176 barley accessions was analyzed using 26 microsatellite loci, covering all 6 chromosomes. 330 oat accessions were analyzed using 26 microsatellite loci that are mapped only into linkage groups. For 26 barley microsatellite loci, 328 alleles were detected. The average number of alleles per locus was 12.6. In oat, for 26 oat microsatellite loci, 353 alleles were detected. The average number of alleles per locus was 13.6. The average DI (Diversity Index) was 0.11 in barley and 0.09 in oat. Den

Czech name

Charakterizace genetických zdrojů ječmene a ovsa pomocí analýzy mikrosatelitů

Czech description

Ječmen (Hordeum vulgare L.) a oves (Avena sativa L.) jsou důležité zemědělské plodiny. V genové bance VÚRV, v.v.i. Praha ? Ruzyně je uchováváno 1865 položek ozimého ječmene, 2707 položek jarního ječmene a 1998 položek ovsa. Pro studium a uchování genetické variability a rovněž pro vyhledávání významných genů byly ustanoveny expertní core kolekce ječmene a ovsa. Tato studie se zabývá základním studiem diverzity odrůd ječmene a ovsa v rámci ustavených core kolekcí na základě analýzy mikrosatelitů, které patří mezi neutrální markery. Genetická variabilita 176 vzorků ječmene byla studována pomocí 26 mikrosatelitních markerů, vybraných tak, aby zahrnovaly všech 7 chromozomů ječmene. 330 odrůd ovsa bylo analyzováno pomocí 26 mikrosatelitních markerů z několika vazebných skupin genomu ovsa. U ječmene bylo detekováno celkem 328 alel s průměrným počtem alel na lokus 12.6. U ovsa bylo detekováno 353 alel s průměrným počtem alel na lokus 13.6. Průměrný DI (Diversity Index) činil u ječmene 0.11 a

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Czech Journal of Genetics and Plant Breeding

ISSN

1212-1975

e-ISSN

—

Volume of the periodical

43

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

8

Pages from-to

97-104

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—