Assessment of genetic diversity of yellow-seeded rapeseed (Brassica napus L.) accessions by AFLP markers
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F07%3A2464" target="_blank" >RIV/00027006:_____/07:2464 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Assessment of genetic diversity of yellow-seeded rapeseed (Brassica napus L.) accessions by AFLP markers
Original language description
The genetic diversity of 35 yellow-seeded Brassica napus L. accessions originating from China, Czech Republic and Poland was assessed by means of Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) markers based on multiplex PCR using multi-colour fluorescent-labelled primers. Five brown-seeded accessions originated from China and France were selected as outliers. In total, 632 peaks were generated by AFLP reaction using 18 primer combinations. Only distinctly polymorphic markers among them were scored. In total, 242 polymorphic markers were detected with an average of 13.4 markers per primer combination. AFLP analysis separated forty studied accessions into Chinese and European groups by UPGMA clustering and Principal coordinates analysis (PCA). The grouping of accessions based on the cluster and PCA was generally consistent with known pedigree information and geographic origin. Notable geographical divergence was found among Chinese and European yellow-seeded accessions. This information i
Czech name
Studium genetické diversity odrůd řepky (Brassica napus L.) pomocí AFLP markerů
Czech description
Genetická diverzita 35 žlutosemenných odrůd Brassica napus L. pocházejících z Číny, České republiky a Polska bylo analyzováno metodou AFLP. Pět odrůd z Francie a Číny bylo použito jako tzv. outliery. Celkem bylo získáno 632 signálů při 18 primerových kombinacích AFLP. Pouze polymorfní signály byly brány v úvahu. Celkem 242 polymorfních signálů bylo získáno s průměrnou hodnotou 13.4 signálu na primerovou kombinaci. UPGMA a PCA analýzami bylo zjištěno, že rozdělení odrůd odpovídá geografickému rozdělení.Výrazné rozdíly byly zjištěny u žlutosemenných odrůd řepky, což je důležitá informace pro šlechtitele řepky a pro rozšíření genetické variability souboru pěstovaných odrůd řepky.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Czech Journal of Genetics and Plant Breeding
ISSN
1212-1975
e-ISSN
—
Volume of the periodical
43
Issue of the periodical within the volume
3
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
8
Pages from-to
105-112
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—