Identification of Neofabraea alba using PCR

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F08%3A00000047" target="_blank" >RIV/00027006:_____/08:00000047 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Identifikace Neofabraea alba pomocí polymerázové řetězové reakce

Original language description

Kruhová hnědá hniloba jablek a hrušek, kterou způsobuje Neofabraea alba, je v Evropě významnou skládkovou chorobou. Sekvence genů pro ribozomální RNA pěti patogenních druhů rodu Neofabraea jsou v téměř identické, jen ve vnitřních přepisovaných mezernících (ITS1 a ITS2) byly zjištěny malé rozdíly. V ITS1 byl objeven shluk tří nehomologních nukleotidů a v ITS2 shluk dvou nehomologních nukletidů. Tyto rozdíly byly využity při navrhování primerů, které následně umožnily specifickou amplifikaci vybrané sekvence DNA polymerázovou řetězovou reakcí (PCR). Dosažené výsledky ukazují úspěšné využití mezerníků ITS1 a ITS2 pro odlišení blízce příbuzných druhů.

Czech name

Identifikace Neofabraea alba pomocí polymerázové řetězové reakce

Czech description

Kruhová hnědá hniloba jablek a hrušek, kterou způsobuje Neofabraea alba, je v Evropě významnou skládkovou chorobou. Sekvence genů pro ribozomální RNA pěti patogenních druhů rodu Neofabraea jsou v téměř identické, jen ve vnitřních přepisovaných mezernících (ITS1 a ITS2) byly zjištěny malé rozdíly. V ITS1 byl objeven shluk tří nehomologních nukleotidů a v ITS2 shluk dvou nehomologních nukletidů. Tyto rozdíly byly využity při navrhování primerů, které následně umožnily specifickou amplifikaci vybrané sekvence DNA polymerázovou řetězovou reakcí (PCR). Dosažené výsledky ukazují úspěšné využití mezerníků ITS1 a ITS2 pro odlišení blízce příbuzných druhů.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

GF - Diseases, pests, weeds and plant protection

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/QG60123" target="_blank" >QG60123: Research and innovation of diagnostic procedures for economically significant, controlled and quarantine plant pathogenic organisms for the certification program of fruit trees with emphasis on molecular methods</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Mykologické listy

ISSN

1213-5887

e-ISSN

—

Volume of the periodical

105

Issue of the periodical within the volume

105

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

7

Pages from-to

—

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—