All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Next-generation DNA sequencing method for diagnosis of Paenibacillus larvae

The result's identifiers

  • Result code in IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F16%3A00003705" target="_blank" >RIV/00027006:_____/16:00003705 - isvavai.cz</a>

  • Result on the web

    <a href="http://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN978-80-7427-205-9.pdf" target="_blank" >http://www.vurv.cz/sites/File/Publications/ISBN978-80-7427-205-9.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternative languages

  • Result language

    čeština

  • Original language name

    Využití nové generace sekvenování pro diagnostiku původce moru včelího plodu Paenibacillus larvae

  • Original language description

    Metodika je zaměřena na využití sekvenování nové generace pro diagnostiku Paenibacillus larvae, který je původce moru včelího plodu. Použitý metodický přístup umožňuje detekci patogena v různých vývojových stádiích včel včetně dospělých dělnic, které přenášejí infekci. Metoda je tedy vhodná pro preklinickou diagnostiku moru včelího plodu. Popsaným postupem je možné nejen detekovat a kvantifikovat patogena, ale i jiné bakterie, jejichž zastoupení může patogen ovlivňovat. Postup byl ověřován na konkrétním případu moru včelího plodu. Text zahrnuje podrobně popsané postupy laboratorního zpracování vzorků včel, vyhodnocení v bioinformatickém programu mothur a interpretaci dat. Metodika je využitelná pro potřeby laboratoří zabývající se diagnostikou onemocnění včel, je vhodná i pro potřeby výzkumné či didaktické.

  • Czech name

    Využití nové generace sekvenování pro diagnostiku původce moru včelího plodu Paenibacillus larvae

  • Czech description

    Metodika je zaměřena na využití sekvenování nové generace pro diagnostiku Paenibacillus larvae, který je původce moru včelího plodu. Použitý metodický přístup umožňuje detekci patogena v různých vývojových stádiích včel včetně dospělých dělnic, které přenášejí infekci. Metoda je tedy vhodná pro preklinickou diagnostiku moru včelího plodu. Popsaným postupem je možné nejen detekovat a kvantifikovat patogena, ale i jiné bakterie, jejichž zastoupení může patogen ovlivňovat. Postup byl ověřován na konkrétním případu moru včelího plodu. Text zahrnuje podrobně popsané postupy laboratorního zpracování vzorků včel, vyhodnocení v bioinformatickém programu mothur a interpretaci dat. Metodika je využitelná pro potřeby laboratoří zabývající se diagnostikou onemocnění včel, je vhodná i pro potřeby výzkumné či didaktické.

Classification

  • Type

    N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body

  • CEP classification

    GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine

  • OECD FORD branch

Result continuities

  • Project

    <a href="/en/project/QJ1310085" target="_blank" >QJ1310085: New methods for complex diagnostics of Apis mellifera healh state with applications mainly in prevention of illness and for systems increasing their fitness</a><br>

  • Continuities

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Others

  • Publication year

    2016

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data specific for result type

  • Internal product ID

    ISBN 978-80-7427-205-9

  • Regulation ID

    18890/2016-MZE-16232

  • Technical parameters

    Osvědčení pod č.j. 18890/2016-MZE-16232 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydalo Ministerstvo zemědělství, Sekce lesního hospodářství, Odbor státní správy lesů, myslivosti a rybářství dne 15.6.2016. Smlouva o využití výsledku č. 3/2016 byla uzavřena s Českým svazem včelařů, z.s., Křemencova 8, 110 00 Praha 1, IČ: 00443239, DIČ: CZ00443239, zastoupeným předsedkyní Mgr. Jarmilou Machovou a tajemníkem Ing. Petrem Šerákem (uživatel) dne 31.5.2016. Statutární zástupce za VÚRV, v.v.i.: Dr. Ing. Pavel Čermák, ředitel Kontaktní osoba za VÚRV,v.v.i.: Doc. Mgr. Jan Hubert, Ph.D., tel. 233022265, e-mail: hubert@vurv.cz ISBN 978-80-7427-205-9

  • Economical parameters

    Náklady na extrakci DNA z jednoho vzorku se pohybují okolo 100 Kč. Sekvenování jednoho vzorku včetně bioinformatické analýzy obalsti V1-V3 stálo 80 USD. Konkurenční sekvenanční firmy nabízejí 20-30 USD za sekvenaci V4-V5 obůasti 16S rRNA. V této studii byla využita analýza 40 vzorků s odhadovanou cenou 100 tisíc Kč bez nákladů spojených s interpretací výsledků.

  • Certification body designation

    Ministerstvo zemědělství, Sekce lesního hospodářství, Odbor státní správy lesů, myslivosti a rybářství, Těšnov 65/17, 110 00 Praha 1

  • Date of certification

  • Method of use

    C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů