Selection of Suitable Model for the Estimation of Interaction Genotype x Environment in Beef Cattle in the Czech Republic
Result description
The genotype x environment interaction (GxE) for the beef cattle weaning weight has been estimated in data set of 19760 animals. The genotype was represented by 4 breeds. The environment was defined by average body weight in farm and was divided in to 3levels. REML was used for the estimation of the population parameters inside population. Ten mixed-models were tested (in 5 models was the effect GxE). Models had 4 ? 8 random effects (direct, maternal, HYS, permanent maternal environment, GxE) and 2 ? 4fixed effects (sex, age of dam, environment, breed). The suitability of the models was tested by the AIC, likelihood ratio test and by residual variance. The models with the effect GxE had best fit for the estimation of populations parameters in beef cattle.
Keywords
beef cattlegenotype x environment interactionREMLmodel selectionweaning weight
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Výběr vhodného modelu pro odhad interakce genotyp x prostředí u masného skotu v ČR
Original language description
Interakce genotyp x prostředí (GxE) pro hmotnost masného skotu po odstavu byla odhadována na souboru 19760 jedinců. Genotyp byl zastoupen 4 plemeny. Podmínky prostředí byly definovány podle průměrné živé hmotnosti a byly rozděleny do tří úrovní. Pro odhad populačních parametrů uvnitř plemen byla použita metoda REML. Bylo testováno 10 smíšených modelů (v 5 modelech byla zahrnuta interakce genotyp x prostředí). Modely zahrnovaly 4 ? 8 náhodných efektů (přímý, maternální, stádo-rok-období otelení, permanentního prostředí matky, GxE) a 2 ? 4 fixní efekty (pohlaví, věk matky, prostředí, plemeno). Vhodnost jednotlivých modelů byla testována pomocí testů AIC, LR a reziduální variance.
Czech name
Výběr vhodného modelu pro odhad interakce genotyp x prostředí u masného skotu v ČR
Czech description
Interakce genotyp x prostředí (GxE) pro hmotnost masného skotu po odstavu byla odhadována na souboru 19760 jedinců. Genotyp byl zastoupen 4 plemeny. Podmínky prostředí byly definovány podle průměrné živé hmotnosti a byly rozděleny do tří úrovní. Pro odhad populačních parametrů uvnitř plemen byla použita metoda REML. Bylo testováno 10 smíšených modelů (v 5 modelech byla zahrnuta interakce genotyp x prostředí). Modely zahrnovaly 4 ? 8 náhodných efektů (přímý, maternální, stádo-rok-období otelení, permanentního prostředí matky, GxE) a 2 ? 4 fixní efekty (pohlaví, věk matky, prostředí, plemeno). Vhodnost jednotlivých modelů byla testována pomocí testů AIC, LR a reziduální variance.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Biometrické metody a modely v současné vědě a výzkumu
ISBN
80-86548-89-9
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
11
Pages from-to
421-431
Publisher name
ÚKZÚZ
Place of publication
Brno
Event location
Lednice
Event date
Aug 21, 2006
Type of event by nationality
EUR - Evropská akce
UT code for WoS article
—
Basic information
Result type
D - Article in proceedings
CEP
GI - Farm animal breeding and farm animal pedigree breeding
Year of implementation
2006