Differential gene expression associated with Corynebacterium pseudotuberculosis infection in sheep
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F21%3AN0000034" target="_blank" >RIV/00027014:_____/21:N0000034 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://vuzv.cz/_privat/21032.pdf" target="_blank" >https://vuzv.cz/_privat/21032.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Studie diferenciální genové exprese u ovcí infikovaných bakterií Corynebacterium pseudotuberculosis
Original language description
Corynebacterium pseudotuberculosis (C. pseudotuberculosis) je bakteriální původce chronického onemocnění kaseózní lymfadenitida, které způsobuje v chovech malých přežvýkavců značné ekonomické ztráty. Cílem této studie bylo získat detailní informace o patogenezi onemocnění a imunitní odpovědi hostitele u nakažených ovcí analýzou globální genové exprese metodou vysokokapacitního sekvenování. Bylo detekováno průměrně 26 796 transkriptů, to představuje 63% ze všech známých transkriptů ovce. Z přibližně 32 mil. analyzovaných sekvencí bylo 55 – 58 % readů jednoznačně namapováno na referenční genom ovce. Odolné bahnice ze zasaženého chovu měly celkem 245 diferenciálně exprimovaných genů (DEG) oproti kontrolním, zdravým samicím. U nemocných bahnic bylo vyhodnoceno celkem 195 DEG. Nákaza Cps byla příčinou zvýšené regulace 57 biologických procesů, především buněčného cyklu, mitózy, meioze, segregace chromozómů a organel, včetně kontroly těchto procesů. Diferenciálně exprimované geny byly klasifikovány do 54 různých metabolických a signálních biochemických drah, které byly ovlivněny nákazou bakterií Cps a onemocněním CLA. Celkem 21 zapojených signálních drah je možno považovat za součást řízení imunitní odezvy a udržení homeostáze zdravého organismu.
Czech name
Studie diferenciální genové exprese u ovcí infikovaných bakterií Corynebacterium pseudotuberculosis
Czech description
—
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
40203 - Husbandry
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1910082" target="_blank" >QK1910082: Addressing the problem of the occurrence of bacterial, protozoan and viral zoonotic agents in small ruminant breeds</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2021
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů