Whole genome sequencing and its publication in the GenBank database

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027022%3A_____%2F22%3AN0000077" target="_blank" >RIV/00027022:_____/22:N0000077 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
čeština
Original language name
Osekvenovaní celého genomu a zveřejnění v databázi GenBank
Original language description
Znalost celogenomových sekvencí širokého spektra živočichů má velký význam při navrhování metodik specifických pro vybraný druh nebo skupinu druhů. Předkládaný výsledek se zaměřil na možnost identifikace kaprovitých ryb žijících v České republice, a to z důvodu navýšení možné specifity (a nebo naopak univerzality) navrhovaných metodik, respektive primerů, a zároveň pro prozkoumání diverzity a evoluce parvalbuminových genů u ryb. Sekvenace genomu byla provedena u pěti vybraných druhů ryb z čeledi Cyprinidae (Squalius cephalus, Alburnus alburnus, Rutilus rutilus, Scardinius erythrophthalmus, Abramis brama), pro něž dosud nebyla celogenomová data, jakož i sekvence parvalbuminového genu, dostupná. Tyto druhy byly vybrány tak, aby pokrývaly diverzitu kaprovitých ryb žijících v České republice. Zároveň bylo při výběru rybích druhů přihlédnuto k riziku jejich zneužití pro falšování potravin. Dané výstupy jsou volně k dispozici v databázi GenBank pod přístupovým číslem „BioProject ID: PRJNA915854“.
Czech name
Osekvenovaní celého genomu a zveřejnění v databázi GenBank
Czech description
—

Project
<a href="/en/project/QK1910231" target="_blank" >QK1910231: New approaches for the proof of fish meat adulteration using genomic DNA</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Similar results(10)