The methodology of black poplar indentification using DNA markers
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027073%3A_____%2F24%3AN0000052" target="_blank" >RIV/00027073:_____/24:N0000052 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vukoz.cz/wp-content/uploads/2025/01/Metodika-identifikace-topolu-cerneho.pdf" target="_blank" >https://www.vukoz.cz/wp-content/uploads/2025/01/Metodika-identifikace-topolu-cerneho.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Metodika identifikace topolu černého pomocí DNA markerů
Original language description
Tato metodika je určena k ověření druhové čistoty topolu černého a jeho odlišení od topolu kanadského a jejich kříženců na základě fragmentační analýzy 8 markerů (6 diagnostických, 1 informativní, 1 STS marker) seskupených do dvou multiplexů. Pomocí této metodiky a zjištěných velikostí specifických alel topolu bavlníkového lze v testovaném porostu topolů dále zaznamenat možný genetický tok mezi topolem černým a topolem kanadským, které se mezi sebou v přírodě hojně kříží. První generaci kříženců (topol bavlníkový × topol černý, tj. topoly kanadské) lze detekovat snadno již pomocí 1 markeru. Avšak v hybridních populacích můžeme očekávat různé stupně křížení mezi jedinci. Již u první generace zpětných kříženců (BC1, tj. kříženci mezi topolem kanadským a topolem černým) a druhé generace kříženců (topol kanadský × topol kanadský) je situace složitější a nestačí použití jednoho markeru. Kvůli meiotické segregaci alel může u diagnostických markerů nastat s určitou pravděpodobností záměna BC1 kříženců, druhé generace kříženců a dalších generací za topol černý. Tato pravděpodobnost se snižuje s použitím vyššího počtu markerů. Senzitivita testu při použití 6 diagnostických markerů je u první generace kříženců 100 %, u druhé generace kříženců 99,98 % a BC1 kříženců 98,44 %.
Czech name
Metodika identifikace topolu černého pomocí DNA markerů
Czech description
Tato metodika je určena k ověření druhové čistoty topolu černého a jeho odlišení od topolu kanadského a jejich kříženců na základě fragmentační analýzy 8 markerů (6 diagnostických, 1 informativní, 1 STS marker) seskupených do dvou multiplexů. Pomocí této metodiky a zjištěných velikostí specifických alel topolu bavlníkového lze v testovaném porostu topolů dále zaznamenat možný genetický tok mezi topolem černým a topolem kanadským, které se mezi sebou v přírodě hojně kříží. První generaci kříženců (topol bavlníkový × topol černý, tj. topoly kanadské) lze detekovat snadno již pomocí 1 markeru. Avšak v hybridních populacích můžeme očekávat různé stupně křížení mezi jedinci. Již u první generace zpětných kříženců (BC1, tj. kříženci mezi topolem kanadským a topolem černým) a druhé generace kříženců (topol kanadský × topol kanadský) je situace složitější a nestačí použití jednoho markeru. Kvůli meiotické segregaci alel může u diagnostických markerů nastat s určitou pravděpodobností záměna BC1 kříženců, druhé generace kříženců a dalších generací za topol černý. Tato pravděpodobnost se snižuje s použitím vyššího počtu markerů. Senzitivita testu při použití 6 diagnostických markerů je u první generace kříženců 100 %, u druhé generace kříženců 99,98 % a BC1 kříženců 98,44 %.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK22010142" target="_blank" >QK22010142: Black poplar conservation and its application in water management and forestry</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2024
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
3/2024-056
Regulation ID
MZE-73785/2024-16222/M286
Technical parameters
Metodika byla publikována pod ISBN 978-80-87674-52-9 (vázáno), ISBN 978-80-87674-54-3 (online; pdf) a schválena (certifikována) Ministerstvem zemědělství ČR dne 14. 11. 2024 (č.j. MZE-73785/2024-16222/M286). Smlouva o uplatnění metodiky zpracované v rámci řešení výzkumného projektu NAZV QK22010142 byla uzavřena dne s 8.10.2024 s Lesy města Olomouce, a.s. se sídlem Lomená 177/4, 779 00 Olomouc - Neředín, IČ: 28633032, zastoupeny Ing. Davidem Janáskem a Mgr. Miroslavem Žbánkem, MPA; kontaktní osoba Ing. David Janásek, janasek@lesyol.cz a 9.10.2024 s Povodím Vltavy, státním podnikem se sídlem Holečkova 3178/8, Smíchov, 150 00 Praha 5, IČ:70889953, statutární orgán RNDr. Petr Kubala; kontaktní osoba Mgr. Jiří Vait, jiri.vait@pvl.cz.
Economical parameters
Minimalizace možné záměny topolu černého za topol kanadský nebo jejich vzájemné křížence má ekonomicky nevyčíslitelný význam pro lesní a vodní hospodářství ve formě pozitivního vlivu na životní prostředí při zajištění stabilizace ohrožených lesních a břehových porostů i liniových výsadeb. Popsaný postup sníží náklady standardně vybavených laboratoří, neboť využití dvou multiplexů vede k ušetření nákladů na použitých chemických ingrediencích a času.
Certification body designation
Ministerstvo zemědělství, Těšnov 17, Praha 1, Česká republika
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů