The set for defermination of minimal inhibitory concentrations of antimicrobals in anaerobe bacterial pathogens of livestock animals

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F17%3AN0000158" target="_blank" >RIV/00027162:_____/17:N0000158 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5474-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhibicnich_koncentraci.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5474-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhibicnich_koncentraci.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat

Original language description

Výsledek je diagnostický set pro laboratorní in vitro stanovení citlivosti/rezistence klinických izolátů bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat na základě stanovení minimálních inhibičních koncentrací (MIC) mikrodiluční metodou ke 12 antibiotikům (ampicilin, penicilin, ceftiofur, vankomycin, klindamycin, meropenem, tigecyklin, enrofloxacin, tiamulin, tysosin, florfenikol a kombinace trimethoprimu a sulfamethoxazolu). Jedná se o mikrotitrační destičku s 96 jamkami - 12 sloupců (1-12) a 8 řádků (A-H). Ve sloupcích je v růstovém médiu naředěno dvanáct antibiotik používaných k léčbě infekcí zvířat způsobených anaerobními bakteriemi v objemu 200 µl, u jedenácti antibiotik (sloupce 1-11) je na destičce 8 ředění (řádky A-H) a u jednoho antibiotika (sloupec 12) je 7 ředění (řádky B-H) a v řádku A je jamka s 200 µl média bez antibiotika sloužící jako pozitivní kontrola růstu testovaných bakterií. Počáteční koncentrace jednotlivých antibiotik na destičce jsou rozdílné a jsou voleny tak, aby hodnoty MIC vyšetřovaných bakterií zahrnovaly rozmezí breakpointů citlivosti/rezistence podle závazných mezinárodních metodik Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) a European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) rozmezí hodnot MIC bakteriálních kmenů povinně testovaných v rámci kontroly kvality, které je pro jednotlivá antibiotika rozdílné. Pro anaerobní bakterie je použito růstové médium Brucella Broth obohacené heminem a vitamínem K1 (CLSI, EUCAST). Součástí funkčního vzorku je i doporučená interpretace výsledků stanovení MIC pomocí tzv. klinických breakpointů antimikrobiálních látek (EUCAST, CLSI). Vyšetřovaný kmen bakterie lze kategorizovat za předpokladu, že příslušné breakpointy jsou použity v definovaném fenotypovém systému, to znamená, že uvedené breakpointy platí pouze pro anaerobní bakterie. Breakpointy rozdělují izoláty na citlivé, intermediální a rezistentní na základě zjištěné hodnoty MIC, tzn., že je definováno pro každé antibiotikum zvlášť (breakpointy se liší) rozmezí hodnot MIC pro citlivé, intermediální a rezistentní kmeny. Funkčnost setu byla ověřena testováním kontrolního kmene Clostridium difficile ATCC 700057, který je přesně definován a povolené rozmezí zjišťovaných hodnot MIC k antibiotikům obsaženým v setu jsou uvedeny v laboratorních standardech CLSI a EUCAST. Stanovené hodnoty MIC jednotlivých antibiotik musí být v rozmezí definovaných hodnot MIC referenčních kmenů dle CLSI a EUCAST. Metody vyšetření citlivosti/rezistence anaerobních patogenů k antibiotikům a také interpretace zjištěných výsledků nejsou v současné době jednotné a neposkytují proto v některých případech relevantní výsledky pro klinickou veterinární praxi. Využitím funkčního vzorku je možné provádět komplexní vyšetřování nebo monitoring rezistence/citlivosti bakteriálních anaerobních patogenů zvířat s významem pro humánní i veterinární oblast. Realizací těchto metod bude dosažena potřebná úroveň výsledků ke sledování a vyhodnocení šíření rezistencí k antimikrobiálním látkám v bakteriálních populacích.

Czech name

Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat

Czech description

Výsledek je diagnostický set pro laboratorní in vitro stanovení citlivosti/rezistence klinických izolátů bakteriálních anaerobních patogenů hospodářských zvířat na základě stanovení minimálních inhibičních koncentrací (MIC) mikrodiluční metodou ke 12 antibiotikům (ampicilin, penicilin, ceftiofur, vankomycin, klindamycin, meropenem, tigecyklin, enrofloxacin, tiamulin, tysosin, florfenikol a kombinace trimethoprimu a sulfamethoxazolu). Jedná se o mikrotitrační destičku s 96 jamkami - 12 sloupců (1-12) a 8 řádků (A-H). Ve sloupcích je v růstovém médiu naředěno dvanáct antibiotik používaných k léčbě infekcí zvířat způsobených anaerobními bakteriemi v objemu 200 µl, u jedenácti antibiotik (sloupce 1-11) je na destičce 8 ředění (řádky A-H) a u jednoho antibiotika (sloupec 12) je 7 ředění (řádky B-H) a v řádku A je jamka s 200 µl média bez antibiotika sloužící jako pozitivní kontrola růstu testovaných bakterií. Počáteční koncentrace jednotlivých antibiotik na destičce jsou rozdílné a jsou voleny tak, aby hodnoty MIC vyšetřovaných bakterií zahrnovaly rozmezí breakpointů citlivosti/rezistence podle závazných mezinárodních metodik Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) a European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) rozmezí hodnot MIC bakteriálních kmenů povinně testovaných v rámci kontroly kvality, které je pro jednotlivá antibiotika rozdílné. Pro anaerobní bakterie je použito růstové médium Brucella Broth obohacené heminem a vitamínem K1 (CLSI, EUCAST). Součástí funkčního vzorku je i doporučená interpretace výsledků stanovení MIC pomocí tzv. klinických breakpointů antimikrobiálních látek (EUCAST, CLSI). Vyšetřovaný kmen bakterie lze kategorizovat za předpokladu, že příslušné breakpointy jsou použity v definovaném fenotypovém systému, to znamená, že uvedené breakpointy platí pouze pro anaerobní bakterie. Breakpointy rozdělují izoláty na citlivé, intermediální a rezistentní na základě zjištěné hodnoty MIC, tzn., že je definováno pro každé antibiotikum zvlášť (breakpointy se liší) rozmezí hodnot MIC pro citlivé, intermediální a rezistentní kmeny. Funkčnost setu byla ověřena testováním kontrolního kmene Clostridium difficile ATCC 700057, který je přesně definován a povolené rozmezí zjišťovaných hodnot MIC k antibiotikům obsaženým v setu jsou uvedeny v laboratorních standardech CLSI a EUCAST. Stanovené hodnoty MIC jednotlivých antibiotik musí být v rozmezí definovaných hodnot MIC referenčních kmenů dle CLSI a EUCAST. Metody vyšetření citlivosti/rezistence anaerobních patogenů k antibiotikům a také interpretace zjištěných výsledků nejsou v současné době jednotné a neposkytují proto v některých případech relevantní výsledky pro klinickou veterinární praxi. Využitím funkčního vzorku je možné provádět komplexní vyšetřování nebo monitoring rezistence/citlivosti bakteriálních anaerobních patogenů zvířat s významem pro humánní i veterinární oblast. Realizací těchto metod bude dosažena potřebná úroveň výsledků ke sledování a vyhodnocení šíření rezistencí k antimikrobiálním látkám v bakteriálních populacích.

Type

G_funk - Functional sample

CEP classification

—

OECD FORD branch

40301 - Veterinary science

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2017

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

FV- Set na stanovení MIC - anaerobní bakterie

Numerical identification

—

Technical parameters

Výsledek vznikl v rámci grantu TAČR GAMA a v souladu se zadávací dokumentací projektu bude komercializován v následujícím období po ukončení řešení.

Economical parameters

Ekonomické přínosy využívání výsledku lze rozdělit minimálně na dvě oblasti – zisk diagnostických laboratoří prováděním stanovení citlivosti/rezistence anaerobních bakterií k antibiotikům a ekonomický přínos pro chovatele hospodářských zvířat. Ekonomický přínos pro laboratoře bude představovat zisk z provedených vyšetření. Za předpokladu vyšetření v jedné laboratoři cca 500 vzorků ročně při ceně za jedno vyšetření kolem 500,- Kč, by se zisk 20 % z tržeb mohl pohybovat kolem 50 tis. pro jednu laboratoř. Dalším uživatelům výsledků vyšetření - chovatelům hospodářských zvířat se sníží zlepšením diagnostiky ekonomické náklady na léčbu a prevenci onemocnění a zvýší se tržby za prodej zdravotně nezávadných kvalitních potravin a surovin živočišného původu. Přesné vyčíslení přínosů chovatelům není možné, záleží vždy na zdravotní situaci a způsobu managementu v jednotlivých chovech.

Application category by cost

—

Owner IČO

00027162

Owner name

Výzkumný ústav veterinárního lékařství Brno, v.v.i.

Owner country

CZ - CZECH REPUBLIC

Usage type

N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)

Licence fee requirement

—

Web page

https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5474-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhibicnich_koncentraci.pdf