Real-time PCR in detection of potentially pathogenic microalgae of the genus Prototheca

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000104" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000104 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Real-time PCR v detekci potenciálně patogenních mikrořas rodu Prototheca

Original language description

VII. ročník Kongresu klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie (KMINE), pořádaný Českou lékařskou společností ČLS JEP. Olomouc 14.11.-16.11.2019 – poster. Cíl studie: Lidská či zvířecí prototékóza patří spíše mezi vzácné endemické prozánětlivé infekce. Je způsobena achlorofylními mikrořasami rodu Prototheca. Konkrétně P. wickerhamii může kolonizovat kůži pacientů, ale v závažnějších případech napadá i respirační či trávicí trakt. P. zopfii genotyp 2 je často skloňovaná jako nebakteriální původce mastitid dojného skotu. Na rozdíl od bakteriálních infekcí zde léčba antibiotiky neúčinkuje a následuje zbytečné nadužívání antibiotických preparátů, doprovázené ekonomickými ztrátami pro chovatele. Cílem studie bylo vyvinout efektivní systém pro včasnou diagnostiku této zoonózy. Metody: Byly vytvořeny dva unikátní multiplexní real-time PCR systémy s TaqMan sondami, amplifikující úseky genů acetyl CoA reduktázy a velké ribozomální podjednotky, specifické pro jednotlivá Prototheca spp. Tato rychlá a citlivá metoda umožňuje detekci prototékózy v různých matricích, zejména v mléce, prostředí ale i v krvi či tkáních. Výsledky: Byl vytvořen systém dvou multiplexních qPCR s IAC, které umožňují určit nejen zda se ve vzorku Prototheca ssp. vyskytují, ale také přímo detekovat a kvantifikovat patogenní P. zopfii genotyp 2, P. wickerhamii, P. blaschkeae, či nepatogenní P. zopfii genotyp 1. Specifita byla testována na panelu prototék a kvasinek. Závěry: Rychlá detekce a kvantifikace prototékózy může vést k zahájení opatření, snižující výskyt a šíření tohoto potencionálního patogenu v chovech dojného skotu, a tak omezit ztráty na kvalitě a kvantitě mléčné produkce a případné riziko přenosu této infekce na člověka.

Czech name

Real-time PCR v detekci potenciálně patogenních mikrořas rodu Prototheca

Czech description

VII. ročník Kongresu klinické mikrobiologie, infekčních nemocí a epidemiologie (KMINE), pořádaný Českou lékařskou společností ČLS JEP. Olomouc 14.11.-16.11.2019 – poster. Cíl studie: Lidská či zvířecí prototékóza patří spíše mezi vzácné endemické prozánětlivé infekce. Je způsobena achlorofylními mikrořasami rodu Prototheca. Konkrétně P. wickerhamii může kolonizovat kůži pacientů, ale v závažnějších případech napadá i respirační či trávicí trakt. P. zopfii genotyp 2 je často skloňovaná jako nebakteriální původce mastitid dojného skotu. Na rozdíl od bakteriálních infekcí zde léčba antibiotiky neúčinkuje a následuje zbytečné nadužívání antibiotických preparátů, doprovázené ekonomickými ztrátami pro chovatele. Cílem studie bylo vyvinout efektivní systém pro včasnou diagnostiku této zoonózy. Metody: Byly vytvořeny dva unikátní multiplexní real-time PCR systémy s TaqMan sondami, amplifikující úseky genů acetyl CoA reduktázy a velké ribozomální podjednotky, specifické pro jednotlivá Prototheca spp. Tato rychlá a citlivá metoda umožňuje detekci prototékózy v různých matricích, zejména v mléce, prostředí ale i v krvi či tkáních. Výsledky: Byl vytvořen systém dvou multiplexních qPCR s IAC, které umožňují určit nejen zda se ve vzorku Prototheca ssp. vyskytují, ale také přímo detekovat a kvantifikovat patogenní P. zopfii genotyp 2, P. wickerhamii, P. blaschkeae, či nepatogenní P. zopfii genotyp 1. Specifita byla testována na panelu prototék a kvasinek. Závěry: Rychlá detekce a kvantifikace prototékózy může vést k zahájení opatření, snižující výskyt a šíření tohoto potencionálního patogenu v chovech dojného skotu, a tak omezit ztráty na kvalitě a kvantitě mléčné produkce a případné riziko přenosu této infekce na člověka.

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

40301 - Veterinary science

Project

<a href="/en/project/QK1910092" target="_blank" >QK1910092: Non-bacterial agents of mastitis and their influence on the quality and technological properties of milk</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Publication year

2019

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů