Method for analysis of soil samples for the presence of African swine fever virus DNA
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000119" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000119 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5703-Krasna-Metod_postup_anal_vz_zem_na_pritom_DNA_viru_afr_moru_prasat-fin.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5703-Krasna-Metod_postup_anal_vz_zem_na_pritom_DNA_viru_afr_moru_prasat-fin.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Metodický postup analýzy vzorků zeminy na přítomnost DNA viru afrického moru prasat
Original language description
Virus afrického moru prasat patří mezi velmi odolné viry, které dokáží odolávat různým tepelným podmínkám i výkyvům pH. Přítomnost viru bývá nejčastěji prokázaná v krvi a tkání infikovaných jedinců/kadáverů. Zdrojem šíření nákazy můžou být také maso, masné výrobky infikovaných jedinců, kontaminované krmivo, oblečení a boty. V případe výskytu afrického moru prasat u prasat divokých dochází k jejich zvýšenému odstřelu. Virus se může dostat prostřednictvím kontaminované krve či kadáverů do půdy, která může představovat potenciální riziko nákazy. Metoda izolace virové nukleové kyseliny ze vzorků hlíny umožňuje rozšíření možnosti identifikaci tohoto viru v dalších matricích. Díky této metodě bude možné vyšetřit půdu z místa výskytu tohoto onemocnění.
Czech name
Metodický postup analýzy vzorků zeminy na přítomnost DNA viru afrického moru prasat
Czech description
Virus afrického moru prasat patří mezi velmi odolné viry, které dokáží odolávat různým tepelným podmínkám i výkyvům pH. Přítomnost viru bývá nejčastěji prokázaná v krvi a tkání infikovaných jedinců/kadáverů. Zdrojem šíření nákazy můžou být také maso, masné výrobky infikovaných jedinců, kontaminované krmivo, oblečení a boty. V případe výskytu afrického moru prasat u prasat divokých dochází k jejich zvýšenému odstřelu. Virus se může dostat prostřednictvím kontaminované krve či kadáverů do půdy, která může představovat potenciální riziko nákazy. Metoda izolace virové nukleové kyseliny ze vzorků hlíny umožňuje rozšíření možnosti identifikaci tohoto viru v dalších matricích. Díky této metodě bude možné vyšetřit půdu z místa výskytu tohoto onemocnění.
Classification
Type
G<sub>funk</sub> - Functional sample
CEP classification
—
OECD FORD branch
10607 - Virology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1920187" target="_blank" >QK1920187: African swine fever in the Czech Republic: Study of molecular epidemiology and biological characteristics of Czech virus isolates</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2019
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
B0002
Numerical identification
Funkční vzorek 5703/2019
Technical parameters
Technické řešení „Metodický postup analýzy vzorků zeminy na přítomnost DNA viru afrického moru prasat“ umožňuje detekovat přítomnost genomu viru v půdě. Díky kombinaci s komerčním kitem Zymo research předkládaná metoda je schopná eliminovat přítomnost případných inhibitorů amplifikace v qPCR. Citlivost detekce byla stanovena na 400 kopií DNA.
Economical parameters
Ekonomické aspekty v současné době nelze odhadnout. Cena za izolace nukleových z 1 vzorku hlíny o hmotnosti 5 g včetně kvantifikovaní pomocí metody qPCR vychází na 744 Kč bez DPH.
Application category by cost
—
Owner IČO
00027162
Owner name
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v. v. i.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence
Licence fee requirement
A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek
Web page
https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2019/VUVeL-Funkcni_vzorek-5703-Krasna-Metod_postup_anal_vz_zem_na_pritom_DNA_viru_afr_moru_prasat-fin.pdf