xMAP Technology - Multiplex System for Fast Detection of Viruses Associated with Alimentary Infections

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F19%3AN0000195" target="_blank" >RIV/00027162:_____/19:N0000195 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216224:14310/19:00111130

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

xMAP technologie – multiplexní systém pro rychlý průkaz virů spojovaných s alimentárními nákazami

Original language description

XXIII. Celostátní konference virologů – Hradecké virologické dny, 22. – 23.10. 2019. Mikrobiologická bezpečnost potravin a prostředí, v němž žijeme, je v současnosti intenzivně diskutované téma. Narůstající produkce a globální trh vytváří tlak na zajištění dostatečného množství kvalitních potravin a nezávadných zdrojů pitné vody. Oproti minulosti je v této oblasti zvýšená pozornost věnována i významným virovým agens, a to jak v případě intenzivního výzkumu, tak i rutinní diagnostiky. V současnosti používané metody pro detekci přítomnosti virů však mají velkou nevýhodu v omezené možnosti vytvářet multiplexní systémy pro rychlou detekci většího počtu patogenů. Naším cílem je proto vývoj a validace nové robustní detekční metody, která nám umožní překonat zmíněné omezení současných přístupů. K vývoji takovéto metody jsme využili kombinace komerčně dostupné technologie xMAP (Luminex, Texas, USA) s multiplexní ligační reakcí. Otevřená architektura tohoto systému nám umožňuje vytvářet systémy s možností detekce až 50 různých cílů v rámci jedné reakce. Prvním krokem analýzy je reverzní transkripce, poté následuje ligace specifických sond v přítomnosti cílové sekvence. Dalším krokem je amplifikace ligovaných sond. Tyto amplikony nesou fluorescenční signál, který je v poslední fázi analýzy detekován prostřednictvím hybridizace na magnetické mikrosféry a za využití přístroje MAGPIX (Luminex, Texas, USA). V současnosti máme dostupný detekční panel zaměřený na virové patogeny, které jsou nejčastěji spojovány s případy onemocnění, kdy jsou jako zdroj identifikovány kontaminované potraviny či vodní zdroje. Tento panel je zaměřen na detekci viru hepatitidy A a E, humánních norovirů, adenovirů a rotavirů. V blízké budoucnosti je plánováno přidávání dalších původců virových onemocnění pro vytvoření dostatečně robustního systému s požadovanou citlivostí, specifitou a spolehlivostí.

Czech name

xMAP technologie – multiplexní systém pro rychlý průkaz virů spojovaných s alimentárními nákazami

Czech description

XXIII. Celostátní konference virologů – Hradecké virologické dny, 22. – 23.10. 2019. Mikrobiologická bezpečnost potravin a prostředí, v němž žijeme, je v současnosti intenzivně diskutované téma. Narůstající produkce a globální trh vytváří tlak na zajištění dostatečného množství kvalitních potravin a nezávadných zdrojů pitné vody. Oproti minulosti je v této oblasti zvýšená pozornost věnována i významným virovým agens, a to jak v případě intenzivního výzkumu, tak i rutinní diagnostiky. V současnosti používané metody pro detekci přítomnosti virů však mají velkou nevýhodu v omezené možnosti vytvářet multiplexní systémy pro rychlou detekci většího počtu patogenů. Naším cílem je proto vývoj a validace nové robustní detekční metody, která nám umožní překonat zmíněné omezení současných přístupů. K vývoji takovéto metody jsme využili kombinace komerčně dostupné technologie xMAP (Luminex, Texas, USA) s multiplexní ligační reakcí. Otevřená architektura tohoto systému nám umožňuje vytvářet systémy s možností detekce až 50 různých cílů v rámci jedné reakce. Prvním krokem analýzy je reverzní transkripce, poté následuje ligace specifických sond v přítomnosti cílové sekvence. Dalším krokem je amplifikace ligovaných sond. Tyto amplikony nesou fluorescenční signál, který je v poslední fázi analýzy detekován prostřednictvím hybridizace na magnetické mikrosféry a za využití přístroje MAGPIX (Luminex, Texas, USA). V současnosti máme dostupný detekční panel zaměřený na virové patogeny, které jsou nejčastěji spojovány s případy onemocnění, kdy jsou jako zdroj identifikovány kontaminované potraviny či vodní zdroje. Tento panel je zaměřen na detekci viru hepatitidy A a E, humánních norovirů, adenovirů a rotavirů. V blízké budoucnosti je plánováno přidávání dalších původců virových onemocnění pro vytvoření dostatečně robustního systému s požadovanou citlivostí, specifitou a spolehlivostí.

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

10607 - Virology

Project

<a href="/en/project/NV17-31921A" target="_blank" >NV17-31921A: Food-borne viruses - molecular epidemiology and methods for rapid detection</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2019

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů