Multiplex tool for rapid detection of pathogenic viruses associated with contaminated water and the environment

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F21%3AN0000087" target="_blank" >RIV/00027162:_____/21:N0000087 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/00216224:14310/21:00123951

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Multiplexní nástroj pro rychlou detekci patogenních virů spojených s kontaminovanou vodou a prostředím

Original language description

Konference mikrobiologie vody a prostředí, Hotel Kamzík, Malá Morávka, termín konání 9.-11.6.2021. Virová agens se v poslední době dostávají do popředí zájmu, a to i ve spojitosti s možnou kontaminací vodních zdrojů a prostředí. Nejčastějšími následky onemocnění, která se s těmito kontaminacemi pojí, jsou gastroenteritidy projevující se horečkou, zvracením a vodnatými průjmy. Kromě mírných horečnatých onemocnění však mohou viry způsobovat i závažnější stavy – infekce dýchacího ústrojí, hepatitidy, konjunktivitidy, aseptické meningitidy, myokarditidy, encefalitidy či paralýzy. V současnosti rutinně používané metody pro detekci těchto agens mají své limity. Jedním z nejpodstatnějších je omezená možnost vytvářet multiplexní systémy pro detekci většího množství patogenů současně. Z tohoto důvodu jsme vyvinuli nový detekční nástroj, který nám toto omezení umožní překonat. Zkombinovali jsme metodu multiplexní ligační reakce a PCR s komerčně dostupnou technologií xMAP (Luminex corporation, Texas, USA). Kombinace těchto metod nám umožňuje vytvářet otevřené detekční systémy až pro 50 různých cílů. Pro detekci virů spojených s alimentárními nákazami byl vyvinut a optimalizován panel zahrnující ty nejvíce diskutované původce - noroviry, viry hepatitidy A a E, adenoviry a rotaviry. Spolehlivost tohoto panelu byla ověřena i mezilaboratorními testy, kdy byl potvrzen limit detekce této metody, 5 × 100 až 5 × 101 genomových ekvivalentů v reakci. Tento systém tak představuje rychlou, robustní, spolehlivou a dostatečně citlivou metodu pro možné monitorování a kontrolu mikrobiologické bezpečnosti potravin, vodních zdrojů a prostředí, kromě toho může sloužit i jako pomocný nástroj při epidemiologických šetřeních. V souvislosti s aktuální epidemiologickou situací byl tento detekční panel doplněn o systémy cílené na viry způsobující respirační onemocnění (tzn. původce nového onemocnění COVID-19 a chřipek A a B).

Czech name

Multiplexní nástroj pro rychlou detekci patogenních virů spojených s kontaminovanou vodou a prostředím

Czech description

—

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

10607 - Virology

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2021

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů