A diagnostic tool for multiplex detection and differentiation of the main bacterial agents causing abscesses in small ruminants
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F21%3AN0000197" target="_blank" >RIV/00027162:_____/21:N0000197 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/11/FV4176_Final_Markova.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/11/FV4176_Final_Markova.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Diagnostický prostředek pro multiplexní detekci a rozlišení hlavních bakteriálních původců vyvolávajících abscesy u malých přežvýkavců
Original language description
Metodika funkčního vzorku popisuje PCR s multiplexní oligonukleotidovou ligací (MOL-PCR) pro diagnostiku kaseózní lymfadenitidy (caseous lymphadenitis, CLA) ovcí a koz způsobenou bakterií Corynebacterium pseudotuberculosis, ale i dalších vybraných bakteriálních původců nacházejících se v abscesech malých přežvýkavců (Corynebacterium ulcerans, Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus subspecies anaerobius, Streptococcus spp., Trueperella pyogenes a meticilin-rezistentní S. aureus). Tento diagnostický prostředek umožňuje multiplexní in vitro detekci bakteriální DNA ve vzorcích hnisu z mízních uzlin anebo z abscesů a to v rámci jedné reakce. Diagnostický nástroj také obsahuje interní positivní kontrolu, která slouží pro kontrolu správného průběhu MOL-PCR. Vývoj detekční soupravy v rámci funkčního vzorku je jedním z výstupů při řešení projektu Ministerstva Zemědělství QK1910082.
Czech name
Diagnostický prostředek pro multiplexní detekci a rozlišení hlavních bakteriálních původců vyvolávajících abscesy u malých přežvýkavců
Czech description
—
Classification
Type
G<sub>funk</sub> - Functional sample
CEP classification
—
OECD FORD branch
40300 - Veterinary science
Result continuities
Project
<a href="/en/project/QK1910082" target="_blank" >QK1910082: Addressing the problem of the occurrence of bacterial, protozoan and viral zoonotic agents in small ruminant breeds</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2021
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
4176/2021
Numerical identification
ISBN 978-80-7672-012-1
Technical parameters
Pro vývoj detekčního systému využívající tzv. xMAP technologii na přístrojové platformě MagPix byly vybrány hlavní bakteriální původci vyvolávající abscesy u malých přežvýkavců (Corynebacterium pseudotuberculosis, Corynebacterium ulcerans, Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus subspecies anaerobius, Streptococcus species., Trueperella pyogenes a meticilin-rezistentní S. aureus). Diagnostický systém využívá kombinaci xMAP technologie (Luminex corporation, USA), ligační reakce a polymerázové řetězové reakce (PCR) se specifickými oligonukleotidy cílenými na unikátní oblasti v genomu těchto vybraných bakteriálních druhů. Součástí každé reakce je také interní kontrola, která slouží ke kontrole průběhu PCR a odhaluje možnou falešnou negativitu způsobenou inhibicí u analyzovaného vzorku.
Economical parameters
Pro diagnosticky vybavenou laboratoř spočívají náklady v syntéze oligonukleotidů a pořízení spotřebního materiálu, soupravy pro izolaci DNA, chemikálií a enzymů pro ligační esej, PCR reakci a hybridizaci včetně magnetických mikrosfér. Cena materiálu na vyšetření jednoho vzorku v duplikátu se pohybuje kolem 600 Kč (bez DPH). Při zavedení funkčního vzorku do diagnostické praxe se ušetří čas i náklady spojené s analýzou.
Application category by cost
—
Owner IČO
00027162
Owner name
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Owner country
CZ - CZECH REPUBLIC
Usage type
A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence
Licence fee requirement
A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek
Web page
https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/11/FV4176_Final_Markova.pdf