Finding the genetic causes of chronic kidney disease

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F21%3A10436404" target="_blank" >RIV/00216208:11110/21:10436404 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=hhPE-b0IN~" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=hhPE-b0IN~</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Po stopách genetických příčin chronického onemocnění ledvin

Original language description

Chronické onemocnění ledvin (CKD) je komplexní, klinicky heterogenní onemocnění postihující ~10 % populace. Na jeho vzniku a průběhu se podílí kombinace genetických faktorů a vlivů vnějšího prostředí. Genetické faktory přispívají ke vzniku CKD ze 40-75 %. Jednotlivé složky genetické komponenty, tj. geny a jejich varianty, jsou postupně nalézány v rodinách s monogenními (mendelovskými) formami CKD a metodami celogenomových asociačních studií v populačních kohortách pacientů s CKD. Následně je studován příspěvek vzácných i populačně častých genetických variant v těchto genech k rozvoji a průběhu nemoci, jak u pacientů s monogenními formami CKD, tak i v běžné populaci. V současnosti je známo ~650 monogenních forem CKD. Jsou zodpovědné za ~70 % pediatrických a ~20 % dospělých případů. Jejich zastoupení je s výjimkou mutací v genech PKD1, PKD2, COL4A3-5, UMOD a MUC1 v populacích pacientů heterogenní a jednotlivě vzácné. Kritickým předpokladem úspěšné diagnostiky a výzkumu je motivace, aktivní přístup a spolupráce lékařů, pacientů a specializovaných laboratoří. Základním nástrojem diagnostiky CKD je exomové sekvenování. To v závislosti na způsobu klinického výběru pacientů umožňuje určit genetickou příčinu v ~30 % studovaných případů. U nevyřešených případů s podezřením na geneticky podmíněné CKD se zaměřujeme na lepší genetickou a funkční analýzu nalezených variant, případně jejich kombinací. Přistupujeme k sekvenaci celého genomu a analýze nekódujících mutací. Zvláštní kapitolu představuje analýza repetitivních a homologních oblastí lidského genomu a interpretace jejich variability. Pro ustanovení kauzality většiny takto určených genetických změn musíme provést cílenou analýzu tělních tekutin a tkání pacientů, případně vhodných buněčných a zvířecích modelů připravených metodami buněčného reprogramování nebo cílených změn genomu.

Czech name

Po stopách genetických příčin chronického onemocnění ledvin

Czech description

Chronické onemocnění ledvin (CKD) je komplexní, klinicky heterogenní onemocnění postihující ~10 % populace. Na jeho vzniku a průběhu se podílí kombinace genetických faktorů a vlivů vnějšího prostředí. Genetické faktory přispívají ke vzniku CKD ze 40-75 %. Jednotlivé složky genetické komponenty, tj. geny a jejich varianty, jsou postupně nalézány v rodinách s monogenními (mendelovskými) formami CKD a metodami celogenomových asociačních studií v populačních kohortách pacientů s CKD. Následně je studován příspěvek vzácných i populačně častých genetických variant v těchto genech k rozvoji a průběhu nemoci, jak u pacientů s monogenními formami CKD, tak i v běžné populaci. V současnosti je známo ~650 monogenních forem CKD. Jsou zodpovědné za ~70 % pediatrických a ~20 % dospělých případů. Jejich zastoupení je s výjimkou mutací v genech PKD1, PKD2, COL4A3-5, UMOD a MUC1 v populacích pacientů heterogenní a jednotlivě vzácné. Kritickým předpokladem úspěšné diagnostiky a výzkumu je motivace, aktivní přístup a spolupráce lékařů, pacientů a specializovaných laboratoří. Základním nástrojem diagnostiky CKD je exomové sekvenování. To v závislosti na způsobu klinického výběru pacientů umožňuje určit genetickou příčinu v ~30 % studovaných případů. U nevyřešených případů s podezřením na geneticky podmíněné CKD se zaměřujeme na lepší genetickou a funkční analýzu nalezených variant, případně jejich kombinací. Přistupujeme k sekvenaci celého genomu a analýze nekódujících mutací. Zvláštní kapitolu představuje analýza repetitivních a homologních oblastí lidského genomu a interpretace jejich variability. Pro ustanovení kauzality většiny takto určených genetických změn musíme provést cílenou analýzu tělních tekutin a tkání pacientů, případně vhodných buněčných a zvířecích modelů připravených metodami buněčného reprogramování nebo cílených změn genomu.

Type

J_ost - Miscellaneous article in a specialist periodical

CEP classification

—

OECD FORD branch

30101 - Human genetics

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2021

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Aktuality v nefrologii

ISSN

1210-955X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

27

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

10

Pages from-to

15-26

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—