HLA, NFKB1 and NFKBIA gene polymorphism profile in autoimmune diabetes mellitus patients

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11120%2F07%3A00000248" target="_blank" >RIV/00216208:11120/07:00000248 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

HLA, NFKB1 and NFKBIA gene polymorphism profile in autoimmune diabetes mellitus patients

Original language description

Type 1 diabetes mellitus (T1DM) is one of the long-time studied autoimmune disorders. The triggering of the autoimmune process has been ascribed to various genes active in the regulation of the cytokine gene transcription including the Rel/NF-&#954;B gene family. In our study the gene polymorphism of HLA class II, NFKB1 (nuclear factor of kappa light polypeptide gene enhancer in B-cells 1) and NFKBIA (inhibitor of nuclear factor kappa B) was tested. Patients were divided into the subgroups in relation to the disease type: T1DM in children, T1DM in adults, and Latent Autoimmune Diabetes in Adults (LADA). HLA-DRB1*04 and HLA-DQB1*0302 have been detected as risk factors for T1DM in adults and particularly in children (P< 0.0001, OR=22.9 and 46.5 respectively). HLA-DRB1*03 has been found as a single risk factor for LADA (P< 0.0001, OR=4.9). We detected 15 alleles for the NFKB1 gene polymorphism (CA-repeats) in the Czech population. The alleles were ranging in size from 114 -142 bp correspo

Czech name

Polymorfismus genů HLA, NFKB1 a NFKBIA u pacientů s autoimunitním diabetes mellitus

Czech description

V této studii byl sledován polymorfismus genů HLA II. třídy, genu pro NFKB1 a jeho inhibitoru NFKBIA u skupiny LADA, T1DM manifestovaného v dospělosti a T1DM u dětí. HLA-DRB1*04 a HLA-DQB1*0302 byly shledány jako rizikové faktory pro T1DM u dospělých i dětí (P< 0.0001, OR=22.9 a 46.5). HLA-DRB1*03 se ukázal jako rizikový faktor vývoje LADA diabetes. Bylo detekováno 15 alel CA polymorfismu NFKB1 genu; frekvence alely A7 byla signifikantně zvýšena u dětského T1DM (P<0.01). V distribuci A a G alely NFKBIAgenu se jednotlivé diabetické skupiny nelišily ve srovnání s kontrolním souborem. Na základě získaných dat byla provedena také expresní studie. Studované polymorfismy HLA, NFKB1 ani NFKBIA genů však nemají vliv na mRNA expresi HLA-DRB1*04 a NFKB1.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Experimental and Clinical Endocrinology & Diabetes

ISSN

0947-7349

e-ISSN

—

Volume of the periodical

115

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

6

Pages from-to

124-129

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—