Method of molecular sex determination of birds
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F22%3A10452540" target="_blank" >RIV/00216208:11310/22:10452540 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://isdv.upv.cz/webapp/resdb.print_detail.det?pspis=PT/2021-90&plang=CS" target="_blank" >https://isdv.upv.cz/webapp/resdb.print_detail.det?pspis=PT/2021-90&plang=CS</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Způsob molekulárního určení pohlaví ptáků
Original language description
Způsob molekulárního určení pohlaví ptáků porovnáním počtu kopií genů specifických pro chromozom Z pomocí qPCR prováděný tak, že se izoluje DNA ze samce a samice daného druhu a jedince neznámého pohlaví, pomocí qPCR se amplifikuje alespoň jeden referenční autosomální gen, alespoň jeden kontrolní autosomální gen a alespoň jeden Z-specifický gen, u každého vzorku se odhadne hodnota prahového cyklu pro každý gen, pro každý amplifikovaný gen se vypočte poměr dávky cílového genu k referenčnímu genu, vypočte se poměr relativní genové dávky mezi samcem a samicí pro každý cílový gen, provede se kontrola Z-specificity u předpokládaných Z-specifických genů a kontrolních autosomálních genů a identifikuje se pohlaví u jedince neznámého pohlaví porovnáním dávky cílového genu pro Z-specifické geny s výsledky u samce a samice, přičemž jako Z-specifický gen se použije gen LPAR1, u běžců geny DOCK8, FUT10, PIGG a PSD3, u letců pak geny CHRNA6, DDX4, TMEM161B a VPS13A.
Czech name
Způsob molekulárního určení pohlaví ptáků
Czech description
Způsob molekulárního určení pohlaví ptáků porovnáním počtu kopií genů specifických pro chromozom Z pomocí qPCR prováděný tak, že se izoluje DNA ze samce a samice daného druhu a jedince neznámého pohlaví, pomocí qPCR se amplifikuje alespoň jeden referenční autosomální gen, alespoň jeden kontrolní autosomální gen a alespoň jeden Z-specifický gen, u každého vzorku se odhadne hodnota prahového cyklu pro každý gen, pro každý amplifikovaný gen se vypočte poměr dávky cílového genu k referenčnímu genu, vypočte se poměr relativní genové dávky mezi samcem a samicí pro každý cílový gen, provede se kontrola Z-specificity u předpokládaných Z-specifických genů a kontrolních autosomálních genů a identifikuje se pohlaví u jedince neznámého pohlaví porovnáním dávky cílového genu pro Z-specifické geny s výsledky u samce a samice, přičemž jako Z-specifický gen se použije gen LPAR1, u běžců geny DOCK8, FUT10, PIGG a PSD3, u letců pak geny CHRNA6, DDX4, TMEM161B a VPS13A.
Classification
Type
P - Patent
CEP classification
—
OECD FORD branch
10600 - Biological sciences
Result continuities
Project
—
Continuities
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Others
Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Patent/design ID
309164
Publisher
CZ001 -
Publisher name
Industrial Property Office
Place of publication
Prague
Publication country
CZ - CZECH REPUBLIC
Date of acceptance
Feb 16, 2022
Owner name
Univerzita Karlova
Method of use
A - Výsledek využívá pouze poskytovatel
Usage type
A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence