Transkriptome of Treponema pallidum: gene expression levels during experimental rabbit infection

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F03%3A00012309" target="_blank" >RIV/00216224:14110/03:00012309 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků

Original language description

Byla studována úroveň genové exprese u spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum (kmen Nichols) kultivované v podmínkách in vivo v králičích varlatech. Spirochety byly izolovány 10 dní po inokulaci a poté z nich byla izolována chromosomální DNA a celková RNA. DNA a RNA byla - po označení flourescenčními barvivy - hybridizována na DNA čipech, které obsahují PCR produkty všech 1039 predikovaných genů T. pallidum. Nejsilněji transkribované geny (geny s nejvyšším poměrem mezi značenou RNA a DNA) odpovídaly proteinům s nejvýraznějším signálem identifikovaným na dvourozměrné gelové elektroforéze. Tyto geny kódují flagelární a cyplasmatické filamentární proteiny, lipoproteiny a membránové antigeny, chaperoniny, proteiny treponemálního redox systému, chemotaktické regulační proteiny, komponenty V-ATPázového systému a některé enzymy (např. glykolytické dráhy). Výsledky získané pomocí DNA čipů byly nezávisle potvrzeny pomocí PCR analýzy v reálném čase. Stanovení genové exprese touto metodou

Czech name

Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků

Czech description

Byla studována úroveň genové exprese u spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum (kmen Nichols) kultivované v podmínkách in vivo v králičích varlatech. Spirochety byly izolovány 10 dní po inokulaci a poté z nich byla izolována chromosomální DNA a celková RNA. DNA a RNA byla - po označení flourescenčními barvivy - hybridizována na DNA čipech, které obsahují PCR produkty všech 1039 predikovaných genů T. pallidum. Nejsilněji transkribované geny (geny s nejvyšším poměrem mezi značenou RNA a DNA) odpovídaly proteinům s nejvýraznějším signálem identifikovaným na dvourozměrné gelové elektroforéze. Tyto geny kódují flagelární a cyplasmatické filamentární proteiny, lipoproteiny a membránové antigeny, chaperoniny, proteiny treponemálního redox systému, chemotaktické regulační proteiny, komponenty V-ATPázového systému a některé enzymy (např. glykolytické dráhy). Výsledky získané pomocí DNA čipů byly nezávisle potvrzeny pomocí PCR analýzy v reálném čase. Stanovení genové exprese touto metodou

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/NI7351" target="_blank" >NI7351: Comparative genomics of pathogenic spirochetes of the genus Treponema: the route towards sequence-specific diagnostics</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2003

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

14-15

Publisher name

Lékařská fakulta MU

Place of publication

Brno

Event location

Brno, Komenského nám. 2

Event date

Jun 4, 2003

Type of event by nationality

CST - Celostátní akce

UT code for WoS article

—