Genomic restriction profiles of the selected strains of the genus Treponema
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F04%3A00012108" target="_blank" >RIV/00216224:14110/04:00012108 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema
Original language description
Byl získán restrikční profil 52 oblastí (69 % genomu) u studovaných treponemálních kmenů. U dvou oblastí (TPI8 a TPI48) byla zjištěna delece v genomu T. paraluiscuniculi. Delece v TPI8 je přibližně 200 bp velká a nachází se v nekódující oblasti. Delece vTPI48 je velká přibližně 2,7 kb a zahrnuje 4 geny tprI, tprJ a dva geny kódující oblasti o neznámé funkci. U jedné oblasti (TPI2) byla nalezena inzerce o velikosti přibližně 150 bp v genomu T. paraluiscuniculi. U 16 TPI oblastí byl nalezen odlišný restrikční profil: u 2 oblastí T. pallidum subsp. pertenue Samoan D a u 15 oblastí T. paraluiscuniculi. Rozdílného restrikčního profilu v oblasti TPI80 (jak u kmene Samoan D, tak a u T. paraluiscuniculi) při štěpení Xba I bylo využito k jejich odlišení od ostatních kmenů. U zbývajících oblastí byl nalezen stejný restrikční profil pro jednotlivá štěpení příslušnými restrikčními enzymy. Výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ačkoliv je patogenita studovaných
Czech name
Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema
Czech description
Byl získán restrikční profil 52 oblastí (69 % genomu) u studovaných treponemálních kmenů. U dvou oblastí (TPI8 a TPI48) byla zjištěna delece v genomu T. paraluiscuniculi. Delece v TPI8 je přibližně 200 bp velká a nachází se v nekódující oblasti. Delece vTPI48 je velká přibližně 2,7 kb a zahrnuje 4 geny tprI, tprJ a dva geny kódující oblasti o neznámé funkci. U jedné oblasti (TPI2) byla nalezena inzerce o velikosti přibližně 150 bp v genomu T. paraluiscuniculi. U 16 TPI oblastí byl nalezen odlišný restrikční profil: u 2 oblastí T. pallidum subsp. pertenue Samoan D a u 15 oblastí T. paraluiscuniculi. Rozdílného restrikčního profilu v oblasti TPI80 (jak u kmene Samoan D, tak a u T. paraluiscuniculi) při štěpení Xba I bylo využito k jejich odlišení od ostatních kmenů. U zbývajících oblastí byl nalezen stejný restrikční profil pro jednotlivá štěpení příslušnými restrikčními enzymy. Výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ačkoliv je patogenita studovaných
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2004
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Bulletin Československé společnosti mikrobiologické
ISSN
0009-0646
e-ISSN
—
Volume of the periodical
XXXXV
Issue of the periodical within the volume
A
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
1
Pages from-to
275
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—