Mapping the interactions of colicins U and Y with their receptor OmpA
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F08%3A00027995" target="_blank" >RIV/00216224:14110/08:00027995 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/00216224:14110/06:00024044
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
slovinština
Original language name
Zmapovanie interakcií kolicínov U a Y s receptorom OmpA
Original language description
OmpA (outer membrane protein A) je proteín bunečného povrchu gramnegatívnych baktérií, tvorený dvoma doménami, transmembránovým b súdkom a globulárnou C doménou v periplazme. Predpokladá sa význam OmpA pri spojení vonkajšej membrány s peptidoglykánom. OmpA je využívaný tiež ako receptor baktériofágov a kolicínov. Interakcia s OmpA bola potvrdená u štyroch kolícínov U, Y, K a L. Ako receptor zodpovedný za primárnu interakciu sa uplatňuje iba v prípade kolicínov U a Y. U zvyšných dvoch kolicínov (K a L) ma funkciu pomocnú. Baktérie rodu Escherichia coli a Enterobacter aerogenes, líšiace sa v citlivosti ku kolicínom U, Y, K a L, syntetizujú OmpA s rozdielnou sekvenciou aminokyselín. Identifikované variabilné oblasti povrchových slučiek boli rozdelené na 11 segmentov o dĺžke 1 až 3 aminokyseliny. Tieto segmenty boli následne mutagenizované pomocou PCR. 11 párov navrhnutých primerov nieslo špecifickú mutáciu, obsahujúcu sekvenciu aminokyselín z OmpA E. aerogenes. Ako templát pri amplifikáci
Czech name
Zmapovanie interakcií kolicínov U a Y s receptorom OmpA
Czech description
OmpA (outer membrane protein A) je protein buněčného povrchu gramnegativních bakterií, tvořený dvěma doménami transmembránovým b skládaným listem a globulární C-doménou v periplazmě. Předpokladá se význam OmpA při spojení vnější membrány s peptidoglykanem. OmpA je využívaný též jako receptor bakteriofágů a kolicínů. Interakcia s OmpA byla potvrzená u čtyř kolicinů U, Y, K a L.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů