Oral bacterioma in patients with squamous cell carcinoma based on their gingival status: a pilot study

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F23%3A00130315" target="_blank" >RIV/00216224:14110/23:00130315 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie

Original language description

Úvod: Orální dlaždicobuněčný karcinom (OSCC) je nejčastější malignitou v oblasti hlavy a krku. Mezi faktory, jež ovlivňují etiopatogenezi OSCC se řadí mj. orální dysbióza a malhygiena. Ve srovnání s ozubenými mají lidé s úplnou ztrátou zubů (podobně jako lidé s dobrou orální hygienou) méně diverzní orální bakteriom. Ve studiích kontrol a případů byla pozorována významně větší bakteriální diverzita na povrchu tumoru u pacientů s OSCC ve srovnání se vzorky zdravé orální mukózy u kontrol. Cílem této pilotní studie bylo analyzovat a srovnat bakteriom na povrchu tumoru a z dentálního plaku a zjistit, zda se bakteriální osídlení povrchu tumoru liší v závislosti na stavu dentice u pacientů s OSCC. Metody: 32 pacientů s histopatologicky potvrzenou diagnózou OSCC jsme rozdělili do 3 skupin dle stavu jejich dentice na bezzubé, málo ozubené (&lt;16 zubů) a více ozubené (≥16 zubů). U všech byl odebrán stěr z povrchu tumoru a u ozubených navíc i stěr dentálního plaku. Mikrobiální DNA jsme izolovali pomocí kitu QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), a dále jsme provedli amplifikaci hypervariabilní oblasti 16S rRNA a připravili knihovnu pro sekvenování nové generace na přístroji Illumina MiSeq. Výsledky: Alfa diverzita bakteriomu byla srovnatelná v matricích získaných stěrem z tumoru a dentálního plaku (p &gt; 0,05). V obou typech vzorků patřily mezi jedny z nejvíce zastoupených rodů Streptococcus, Fusobacterium a Porphyromonas. Nalezli jsme rozdíl v bakteriální diverzitě (dle ASV) z povrchu tumoru při porovnání bezzubých pacientů a pacientů málo ozubených (&lt;16 zubů; p &lt; 0,05); u více ozubených pacientů jsme pozorovali pouze obdobný trend (p &gt; 0,05). Relativní abundance rodu Dialister sp. na povrchu tumoru byla vyšší u málo ozubených ve srovnání s více ozubenými pacienty (p &lt; 0,05), zatímco mezi bezzubými a málo ozubenými nebyl v tomto rozdíl (p &gt; 0,05). Úroveň orální hygieny i počet ASV u vzorků dentálního plaku byli podobné mezi skupinami ozubených pacientů (p &gt; 0,05). Shrnutí: Výsledky naší pilotní studie ukázaly, že pacienti zcela bez zubů mají nižší bakteriální diverzitu na povrchu tumoru než ti ozubení. To potvrzuje hypotézu, že orální bakteriom u pacientů s OSCC je ovlivněn stavem jejich dentice.

Czech name

Orální bakteriom u pacientů s dlaždicobuněčným karcinomem dle stavu jejich dentice: pilotní studie

Czech description

Úvod: Orální dlaždicobuněčný karcinom (OSCC) je nejčastější malignitou v oblasti hlavy a krku. Mezi faktory, jež ovlivňují etiopatogenezi OSCC se řadí mj. orální dysbióza a malhygiena. Ve srovnání s ozubenými mají lidé s úplnou ztrátou zubů (podobně jako lidé s dobrou orální hygienou) méně diverzní orální bakteriom. Ve studiích kontrol a případů byla pozorována významně větší bakteriální diverzita na povrchu tumoru u pacientů s OSCC ve srovnání se vzorky zdravé orální mukózy u kontrol. Cílem této pilotní studie bylo analyzovat a srovnat bakteriom na povrchu tumoru a z dentálního plaku a zjistit, zda se bakteriální osídlení povrchu tumoru liší v závislosti na stavu dentice u pacientů s OSCC. Metody: 32 pacientů s histopatologicky potvrzenou diagnózou OSCC jsme rozdělili do 3 skupin dle stavu jejich dentice na bezzubé, málo ozubené (&lt;16 zubů) a více ozubené (≥16 zubů). U všech byl odebrán stěr z povrchu tumoru a u ozubených navíc i stěr dentálního plaku. Mikrobiální DNA jsme izolovali pomocí kitu QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), a dále jsme provedli amplifikaci hypervariabilní oblasti 16S rRNA a připravili knihovnu pro sekvenování nové generace na přístroji Illumina MiSeq. Výsledky: Alfa diverzita bakteriomu byla srovnatelná v matricích získaných stěrem z tumoru a dentálního plaku (p &gt; 0,05). V obou typech vzorků patřily mezi jedny z nejvíce zastoupených rodů Streptococcus, Fusobacterium a Porphyromonas. Nalezli jsme rozdíl v bakteriální diverzitě (dle ASV) z povrchu tumoru při porovnání bezzubých pacientů a pacientů málo ozubených (&lt;16 zubů; p &lt; 0,05); u více ozubených pacientů jsme pozorovali pouze obdobný trend (p &gt; 0,05). Relativní abundance rodu Dialister sp. na povrchu tumoru byla vyšší u málo ozubených ve srovnání s více ozubenými pacienty (p &lt; 0,05), zatímco mezi bezzubými a málo ozubenými nebyl v tomto rozdíl (p &gt; 0,05). Úroveň orální hygieny i počet ASV u vzorků dentálního plaku byli podobné mezi skupinami ozubených pacientů (p &gt; 0,05). Shrnutí: Výsledky naší pilotní studie ukázaly, že pacienti zcela bez zubů mají nižší bakteriální diverzitu na povrchu tumoru než ti ozubení. To potvrzuje hypotézu, že orální bakteriom u pacientů s OSCC je ovlivněn stavem jejich dentice.

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

10608 - Biochemistry and molecular biology

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2023

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů