Comparison of bacterioma from tumor and oral mucosa in patients with oral squamous cell carcinoma

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F22%3A00126784" target="_blank" >RIV/00216224:14310/22:00126784 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Komparace bakteriomu z tumoru a ze sliznic dutiny ústní u pacientů s orálním dlaždicobuněčným karcinomem

Original language description

Úvod: Orální dlaždicobuněčný karcinom (OSCC) je nejčastější malignitou v oblasti hlavy a krku. Přítomnost Gram-negativních anaerobů, jako je Fusobacterium nucleatum a Treponema denticola, v dutině ústní je spojována s tímto onemocněním. Je známo, že mikrobiom v dutině ústní je závislý dle lokalizace, např. na dorzu jazyka a bukální sliznici dominuje Gram-pozitivní Steptococcus. Cílem této pilotní studie je analyzovat orální bakteriom v různých lokalitách dutiny ústní u pacientů s OSCC a zjistit, zda se bakteriom na povrchu tumoru liší od bakteriomu z lokalizací bez klinického nálezu. Metody: Od 33 pacientů s histopatologicky potvrzenou diagnózou OSCC byly odebrány 3 stěry ze sliznice dutiny ústní (stěr z povrchu tumoru, bukální sliznice a jazyka bez klinického nálezu). Mikrobiální DNA byla izolována z jednotlivých matric pomocí kitu QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), a dále byla provedena amplifikace hypervariabilní oblasti 16S rRNA. Následně byla připravena knihovna pro sekvenování nové generace na přístroji Illumina MiSeq. Výsledky: Nejvíce abundantními rody v orálních vzorcích byly Streptococcus, Fusobacterium, Prevotella_7 a Veillonella. Alfa diverzita bakteriomu mezi jednotlivými matricemi byla srovnatelná (p &gt; 0,05). Nicméně, relativní abundance u rodu Rothia byla signifikantně nižší u stěru z tumoru oproti bukální sliznici či jazyku (p ≤ 0,001, q = 0,003). Rody Actinomyces a Atopobium byly méně zastoupeny na povrchu tumoru, zatímco Prevotella_2, Parvimonas, Catonella, Peptostreptococcus, Fusobacterium, Aggregatibacter a Treponema více při porovnání oproti povrchu jazyka (q &lt; 0,05), nikoliv však oproti bukálnímu stěru (p &gt; 0,05). U rodu Streptococcus byla zjištěna nižší relativní abundance u stěru z tumoru než u bukální sliznice (q &lt; 0,05). Shrnutí: U pacientů s OSCC je bakteriom povrchu tumoru odlišný od povrchu jazyka či bukální sliznice. Vyšší výskyt parodontálních bakterií na povrchu tumoru oproti dalším slizničním lokalitám bez zjevné patologie podporuje hypotézu o jejich významu v etiopatogenezi tohoto onemocnění. Pilotní výsledky je třeba ověřit na větším vzorku pacientů.

Czech name

Komparace bakteriomu z tumoru a ze sliznic dutiny ústní u pacientů s orálním dlaždicobuněčným karcinomem

Czech description

Úvod: Orální dlaždicobuněčný karcinom (OSCC) je nejčastější malignitou v oblasti hlavy a krku. Přítomnost Gram-negativních anaerobů, jako je Fusobacterium nucleatum a Treponema denticola, v dutině ústní je spojována s tímto onemocněním. Je známo, že mikrobiom v dutině ústní je závislý dle lokalizace, např. na dorzu jazyka a bukální sliznici dominuje Gram-pozitivní Steptococcus. Cílem této pilotní studie je analyzovat orální bakteriom v různých lokalitách dutiny ústní u pacientů s OSCC a zjistit, zda se bakteriom na povrchu tumoru liší od bakteriomu z lokalizací bez klinického nálezu. Metody: Od 33 pacientů s histopatologicky potvrzenou diagnózou OSCC byly odebrány 3 stěry ze sliznice dutiny ústní (stěr z povrchu tumoru, bukální sliznice a jazyka bez klinického nálezu). Mikrobiální DNA byla izolována z jednotlivých matric pomocí kitu QIAamp DNA Mini Kit (QIAGEN), a dále byla provedena amplifikace hypervariabilní oblasti 16S rRNA. Následně byla připravena knihovna pro sekvenování nové generace na přístroji Illumina MiSeq. Výsledky: Nejvíce abundantními rody v orálních vzorcích byly Streptococcus, Fusobacterium, Prevotella_7 a Veillonella. Alfa diverzita bakteriomu mezi jednotlivými matricemi byla srovnatelná (p &gt; 0,05). Nicméně, relativní abundance u rodu Rothia byla signifikantně nižší u stěru z tumoru oproti bukální sliznici či jazyku (p ≤ 0,001, q = 0,003). Rody Actinomyces a Atopobium byly méně zastoupeny na povrchu tumoru, zatímco Prevotella_2, Parvimonas, Catonella, Peptostreptococcus, Fusobacterium, Aggregatibacter a Treponema více při porovnání oproti povrchu jazyka (q &lt; 0,05), nikoliv však oproti bukálnímu stěru (p &gt; 0,05). U rodu Streptococcus byla zjištěna nižší relativní abundance u stěru z tumoru než u bukální sliznice (q &lt; 0,05). Shrnutí: U pacientů s OSCC je bakteriom povrchu tumoru odlišný od povrchu jazyka či bukální sliznice. Vyšší výskyt parodontálních bakterií na povrchu tumoru oproti dalším slizničním lokalitám bez zjevné patologie podporuje hypotézu o jejich významu v etiopatogenezi tohoto onemocnění. Pilotní výsledky je třeba ověřit na větším vzorku pacientů.

Type

O - Miscellaneous

CEP classification

—

OECD FORD branch

10608 - Biochemistry and molecular biology

Project

<a href="/en/project/LM2018121" target="_blank" >LM2018121: RECETOX RI</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2022

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů