Genomic and proteomic characterization of the polyvalent staphylophage 812

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00010413" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00010413 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Genomic and proteomic characterization of the polyvalent staphylophage 812

Original language description

Virulent and polyvalent staphylophage 812, a member of Myoviridae family, exhibits strong lytic activity on a broad host range of Staphylococcus species, thus being a suitable candidate for treatment of staphylococcal infections. Genome of this phage isrepresented by linear 145 kb dsDNA. Our study was focused on genome and proteome comparison of 812 wild-type phage, its host-range mutants and related phages U16, 131 and SK311 with the aim to explain molecular basis of differences in their host-range. The genomes of phages under study were compared by DNA restriction analysis, and the genomic regions showing differences in individual phages were characterized in details. The proteome analysis included separation of phage protein lysates by 1D SDS-PAGEwith subsequent identification of proteins by peptide mapping using MALDI-TOF mass spectrometry. Comparison of the phage genomes revealed several rearrangements of DNA sequences as well as single nucleotide substitutions in different part

Czech name

Charakterizace genomu a proteomu polyvalentního fága 812

Czech description

Bakteriofág 812, zástupce čeledi Myoviridae, je virulentní polyvalentní fág s ?irokým rozmezím hostitelů, zahrnujícím kmeny a druhy rodu Staphylococcus. Tyto vlastnosti jej činí vhodným kandidátem pro fágovou terapii stafylokokových infekcí. Tato práce byla zaměřena na srovnání genomu a proteomu standardního typu fága 812, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů U16, SK311, 131 a Twort s cílem objastnit molekulární základ jejich rozdílného hostitelského rozmezí. Genomy uvedených fágů tvořené lineární dvouřetězcovou DNA o velikosti 145 kb byly srovnávány pomocí restrikční analýzy. Úseky vykazující u jednotlivých fágů rozdíly byly pak charakterizovány detailně. Pro účely proteomických studií byla pou?ita 1-D SDS-PAGE. Nalezené proteiny byly identifikovány metodou peptidového mapování s vyu?itím MALDI-TOF hmotnostní spektrometrie. Srovnáním fágových genomů byly zji?těny vedle nukleotidových substitucí té? rozsáhlej?í přestavby sekvencí DNA. Inzerce a delece o velikosti ~1 a? 3 k

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA203%2F03%2F0515" target="_blank" >GA203/03/0515: Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry</a><br>

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

11th International Symposium on Staphylococci & Staphylococcal Infections. Plenary Summaries & Poster Abstracts

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

201

Publisher name

Medical University of South Carolina

Place of publication

Charleston, South Carolina, USA

Event location

Charleston, South Carolina, USA

Event date

Oct 24, 2004

Type of event by nationality

WRD - Celosvětová akce

UT code for WoS article

—