Comparative genomics and proteomics of polyvalent staphylococcal bacteriophages

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00011591" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00011591 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Srovnávací analýza genomu a proteomu polyvalentních stafylofágů

Original language description

Virulentní a polyvalentní stafylofágy z čeledi Myoviridae se vyznačují širokým rozmezím hostitelů, které pokrývá řadu druhů rodu Staphylococcus a jsou proto vhodnými kandidáty pro alternativní léčbu stafylokokových infekcí. Genom těchto fágů je tvořen lineární dsDNA o velikosti zhruba 145 kb. Cílem práce bylo srovnání genomu a proteomu fága 812, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů U16, 131 a SK311 a objasnění molekulárního základu rozdílů jejich odlišného rozmezí hostitelů. Genomy studovaných fágů byly nejdříve srovnány restrikční analýzou DNA a oblasti, které vykázály vzájemné rozdíly, byly pak studovány detailně. Analýza proteomu byla provedena jednorozměrnou SDS-PAGE s následnou identifikací proteinů peptidovým mapováním pomocí MALDI-TOF hmotnostní spekrometrií. Srovnání fágových genomů odhalilo četné přestavby sekvencí DNA a nukleotidové substituce lokalizované v různých oblastech. Inzerce a delece o velikostí několika kilobází byly zjištěny zejména v nekódujících kon

Czech name

Srovnávací analýza genomu a proteomu polyvalentních stafylofágů

Czech description

Virulentní a polyvalentní stafylofágy z čeledi Myoviridae se vyznačují širokým rozmezím hostitelů, které pokrývá řadu druhů rodu Staphylococcus a jsou proto vhodnými kandidáty pro alternativní léčbu stafylokokových infekcí. Genom těchto fágů je tvořen lineární dsDNA o velikosti zhruba 145 kb. Cílem práce bylo srovnání genomu a proteomu fága 812, jeho mutant v rozmezí hostitele a příbuzných fágů U16, 131 a SK311 a objasnění molekulárního základu rozdílů jejich odlišného rozmezí hostitelů. Genomy studovaných fágů byly nejdříve srovnány restrikční analýzou DNA a oblasti, které vykázály vzájemné rozdíly, byly pak studovány detailně. Analýza proteomu byla provedena jednorozměrnou SDS-PAGE s následnou identifikací proteinů peptidovým mapováním pomocí MALDI-TOF hmotnostní spekrometrií. Srovnání fágových genomů odhalilo četné přestavby sekvencí DNA a nukleotidové substituce lokalizované v různých oblastech. Inzerce a delece o velikostí několika kilobází byly zjištěny zejména v nekódujících kon

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA203%2F03%2F0515" target="_blank" >GA203/03/0515: Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Bulletin Československé společnocti mikrobiologické

ISSN

0009-0646

e-ISSN

—

Volume of the periodical

45

Issue of the periodical within the volume

Suppl. 3A

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

1

Pages from-to

152

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—