Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00010703" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00010703 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases

Original language description

The paper presents a set of triple-resonance two-dimensional experiments for correlating all quaternary carbons in RNA bases to one or more of the base protons. The experiments make use of either three-bond proton-carbon couplings and one selective INEPTstep (the long-range selective HSQC experiment) to transfer the magnetization between a proton and the carbon of interest and back, or they rely on one- and/or two-bond heteronuclear (the H(CN)C and H(N)C experiments) or carbon-carbon couplings (the H(C)C experiment) and multiple INEPT transfer steps. The effect of the large one-bond carbon-carbon coupling in t1 is removed by a constant time evolution or by a selective refocusing. The performance of the proposed approach is demonstrated on a 0.5 mM 25-mer RNA. The results show that the experiments are applicable to samples containing agents for weak molecular alignment. The design of the correlation experiments has been supported by ab initio calculations of scalar spin-spin couplings

Czech name

Experimenty pro korelaci kvarterních atomů uhlíku v bazích RNA

Czech description

Článek uvádí nové heteronukleární 2D NMR experimenty pro korelaci všech kvarterních uhlíků v bázích RNA s jedním nebo více jádry vodíku. Experimenty jsou založeny na jedno, dvou nebo třívazebných interakcích a několikanásobných přenosech magnetizace. Štěpení signálu vlivem jednovazebné interakce uhlík-uhlík je odstraněno pomozí vývoje v konstantním čase nebo selektivní refokusací. Citlivost navrhovaných experimentů dovoluje naměřit spektra 0.5 mM 25-meru RNA za čtyři hodiny nebo méně. Experimenty jsou aplikovatelné i na vzorky v orietovaných fázích.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

CE - Biochemistry

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/LN00A016" target="_blank" >LN00A016: BIOMOLECULAR CENTER</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Journal of Biomolecular NMR

ISSN

0925-2738

e-ISSN

—

Volume of the periodical

29

Issue of the periodical within the volume

4

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

14

Pages from-to

477-490

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—