Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00010705" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00010705 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Experiments for Correlating Quaternary Carbons in RNA Bases
Original language description
A set of triple-resonance two-dimensional NMR experiments is presented that can be used for correlating all quaternary carbons in RNA bases to one or more of the base protons. The experiments make use of either three-bond proton-carbon couplings and oneselective INEPT step (long-range selective HSQC experiment) to transfer the magnetization between a proton and the carbon of interest and back, or they rely on one- and/or two-bond heteronuclear (the H(CN)C and H(N)C experiments) or carbon-carbon couplings (the H(C)C experiment) and multiple INEPT transfer steps. The effect of the large one-bond carbon-carbon coupling in t1 is removed by a constant time evolution or by a selective refocusing. The sensitivity of all the experiments proposed is high enough to obtain a spectrum of 0.5 mM 25-mer RNA stem-loop in four hours or less on a 600 MHz (1H) spectrometer. The results show that the experiments are also applicable to samples containing agents for weak molecular alignment.
Czech name
NMR experimenty pro korelaci kvarterních uhlíků v bazích RNA
Czech description
Práce představuje nové heteronukleární 2D NMR experimenty pro korelaci všech kvarterních uhlíků v bázích RNA s jedním nebo více jádry vodíku. Experimenty jsou založeny na jedno, dvou nebo třívazebných interakcích a několikanásobných přenosech magnetizace. Štěpení signálu vlivem jednovazebné interakce uhlík-uhlík je odstraněno pomozí vývoje v konstantním čase nebo selektivní refokusací. Citrlivost navrhovaných experimentů dovoluje naměřit spektra 0.5 mM 25-meru RNA za čtyři hodiny nebo méně. Experimentyjsou aplikovatelné i na vzorky v orietovaných fázích.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
CE - Biochemistry
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LN00A016" target="_blank" >LN00A016: BIOMOLECULAR CENTER</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2004
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
19th NMR Valtice
ISBN
80-210-3352-5
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
1
Pages from-to
33
Publisher name
Masarykova univerzita
Place of publication
Brno
Event location
Valtice
Event date
Apr 19, 2004
Type of event by nationality
WRD - Celosvětová akce
UT code for WoS article
—