Sample preparation for proteom analysis of leukemic cells BM2 using two-dimensional electrophoresis

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F04%3A00011469" target="_blank" >RIV/00216224:14310/04:00011469 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou

Original language description

Výsledek dvourozměrné elektroforézy (2D) proteinů výnamně závisí na způsobu přípravy vzorku. Cílem této práce bylo stanovit optimální podmínky pro přípravu vzorku kuřecích monoblastů transormovaných onkogenem v-myb. Modifikací lyzačního (9 M urea, 2 % NP-40, 3 % CHAPS, 70 mM DTT, 2 % ampholyte pH 8-10.5) a rehydratačního pufru (8 M urea, 4 % CHAPS, 100 mM DTT, 0.001 % bromphenol blue, 0.2 % ampholyte pH 3-10)přidáním thiomočoviny jsme zřetelně zvýšili počet proteinů rozlišitelných v 2D gelu. Sonikací vzorku jsme dále zvýšili počet a densitu proteinů na elektroforetogramu. Přítomnost thiomočoviny v lyzačním/rehydratačním pufru a sonikace zvýšila počet rozlišitelných proteinových skvrn přibližně osmkrát. Tyto experimentální podmínky použijeme při analýzeproteomu během diferenciace monoblastů BM2.

Czech name

Příprava vzorku pro analýzu proteomu leukemických buněk BM2 dvourozměrnou elektroforézou

Czech description

Výsledek dvourozměrné elektroforézy (2D) proteinů výnamně závisí na způsobu přípravy vzorku. Cílem této práce bylo stanovit optimální podmínky pro přípravu vzorku kuřecích monoblastů transormovaných onkogenem v-myb. Modifikací lyzačního (9 M urea, 2 % NP-40, 3 % CHAPS, 70 mM DTT, 2 % ampholyte pH 8-10.5) a rehydratačního pufru (8 M urea, 4 % CHAPS, 100 mM DTT, 0.001 % bromphenol blue, 0.2 % ampholyte pH 3-10)přidáním thiomočoviny jsme zřetelně zvýšili počet proteinů rozlišitelných v 2D gelu. Sonikací vzorku jsme dále zvýšili počet a densitu proteinů na elektroforetogramu. Přítomnost thiomočoviny v lyzačním/rehydratačním pufru a sonikace zvýšila počet rozlišitelných proteinových skvrn přibližně osmkrát. Tyto experimentální podmínky použijeme při analýzeproteomu během diferenciace monoblastů BM2.

Type

D - Article in proceedings

CEP classification

FD - Oncology and haematology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/GA301%2F03%2F1055" target="_blank" >GA301/03/1055: Study of molecular mechanisms causing v-Myb suppression using proteomics-based approach</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2004

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Article name in the collection

1. česká proteomická konference

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Number of pages

1

Pages from-to

24

Publisher name

Středisko vědeckotechnických informací UŽFG AV ČR

Place of publication

Mělník

Event location

Mělník

Event date

Jun 15, 2004

Type of event by nationality

CST - Celostátní akce

UT code for WoS article

—