Evaluation of amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and species-specific PCR for identification of Bifidobacterium species

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F06%3A00016570" target="_blank" >RIV/00216224:14310/06:00016570 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Evaluation of amplified ribosomal DNA restriction analysis (ARDRA) and species-specific PCR for identification of Bifidobacterium species

Original language description

Molecular biological methods based on genus and species specific PCR and restriction analysis of two PCR amplicons using six restriction enzymes were used to differentiate among species of Bifidobacterium. Optimalised methods were applied for identification of strains collected in Culture Collection of Dairy Microorganisms. Restriction analysis of longer PCR amplicon was the most discriminative for Bifidobacterium species differentiation. Practicaly observed restriction profiles were compared and confirmed with the theoretical restriction analysis of Bifidobacterium sequences obtained from GenBank database.

Czech name

Zavedení restrikční analýzy amplifikované robozomální 16SrDNA (ARDRA) a druhově specifické PCR pro identifikaci druhů rodu Bifidobacterium

Czech description

Molekulárně-biologické metody (rodově, druhově specifické PCR a restrikční analýza dvou PCR produktů pomocí šesti restrikčních enzymů) byly použity pro diferenciaci druhů rodu Bifidobacterium.Tyto metody byly následně aplikovány pro identifikaci CCDM kultur. Restrikční analýza delšího amplikonu vykazovala největší diskriminační potenciál a umožnila odlišení mezi příbuznými druhy. Správnost praktické restrikční analýzy byla ověřena teoretickou restrikční analýzou sekvencí získaných z databáze GenBank.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EE - Microbiology, virology

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Systematic and Applied Microbiology

ISSN

0723-2020

e-ISSN

—

Volume of the periodical

29

Issue of the periodical within the volume

1

Country of publishing house

DE - GERMANY

Number of pages

9

Pages from-to

36-44

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—