Screening of genomic imbalances in glioblastoma multiforme using high-resolution comparative genomic hybridization

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F07%3A00021808" target="_blank" >RIV/00216224:14310/07:00021808 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Screening of genomic imbalances in glioblastoma multiforme using high-resolution comparative genomic hybridization

Original language description

Comparative genomic hybridization (CGH) is a molecular cytogenetic technique that allows genome-wide analysis of DNA sequence copy number differences. We have applied conventional CGH and recently developed high resolution CGH (HR-CGH) to tumour samplesfrom 18 patients with glioblastoma multiforme (GBM) to compare the sensitivity of CGH and HR-CGH in the screening of chromosomal abnormalities. The abnormalities were studied in topologically different central and peripheral tumour parts. A total of 78 different changes were observed using CGH (0-16 per tumour, median 3.5) and 154 different changes using HR-CGH (0-21 per tumour, median 6). Using HR-CGH, losses were more frequent than gains. The representation of the most prominent changes revealed by both methods was similar and was comprised of the amplification of 7q12-13 and 12q12-q15, the gain of 7, 3q and 19 and the loss of 10, 9p, and 13q. However, HR-CGH detected a few other abnormalities (loss of 6, 14q, 15q, and 18q and gain of

Czech name

Screening genetických abnormalit u glioblastomu s využitím komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením

Czech description

S využitím konvenční komparativní genomové hybridizace (CGH) a novější komparativní genomové hybridizace s vyšším rozlišením (HR-CGH) jsme provedli analýzu vzorků nádorové tkáně celkem 18 pacientů s diagnózou glioblastoma multiforme s cílem porovnat citlivost obou uvedených metod při vyhledávání chromosomálních abnormalit. S využitím konvenční CGH bylo zaznamenáno celkem 78 různých změn (0-16 na nádor, medián 3,5), zatímco s využitím HR-CGH bylo detekováno celkem 154 různých změn (0-21 na nádor, medián6), přičemž ztráty genetického materiálu byly s využitím HR-CGH zaznamenány častěji, než zisky. Nejčastější změny, které bylo možné detekovat oběma metodami, byly amplifikace oblastí 7q12-13 a 12q12-q15, zisky oblastí 7, 3q a 19 a ztráty oblastí 10, 9p a13q. Pomocí metody HR-CGH byly kromě toho prokázány další genetické změny (ztráty oblastí 6, 14q, 15q a 18q a zisk 19), které nebylo možné zjistit metodou konvenční CGH.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/OC%20B19.001" target="_blank" >OC B19.001: Gene Diagnostics and Therapy of Multiform Glioblastoma</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2007

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Oncology Reports

ISSN

1021-335X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

17

Issue of the periodical within the volume

2

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

8

Pages from-to

457-464

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—