Isolation of viral particles from water samples
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F16%3A00099972" target="_blank" >RIV/00216224:14310/16:00099972 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Izolace virových částic ze vzorků vod
Original language description
Cílem příspěvku je porovnání vybraných metod k analýze vzorků vod pro citlivou izolaci a následnou detekci virových částic. Jako izolační metody byly testovány metody filtrace přes kolony se skelnou vatou, membránové filtry a metoda přímé organické flokulace. Aby bylo možné ověřit účinnost testovaných metod a provádět jejich optimalizace, byly využity uměle připravené pseudovirionové částice odvozené od bakteriofága MS2 s unikátní vloženou sekvencí. Pro detekci byla použita reverzně transkripční polymerázová řetězová reakce probíhající v reálném čase. Tato metoda umožnila kvantifikaci virové nálože ve vzorku a tak stanovení účinnosti celého analytického postupu. Na základě výsledků a zkušeností byla vybrána metoda přímé organické flokulace jako nejvhodnější metoda izolace virových částic ze vzorků vod. Oproti ostatním metodám zde bylo možné opakovaně dosáhnout porovnatelných hodnot účinnosti. Metoda byla rovněž výhodná v jednoduchém a časově nenáročném provedení.
Czech name
Izolace virových částic ze vzorků vod
Czech description
Cílem příspěvku je porovnání vybraných metod k analýze vzorků vod pro citlivou izolaci a následnou detekci virových částic. Jako izolační metody byly testovány metody filtrace přes kolony se skelnou vatou, membránové filtry a metoda přímé organické flokulace. Aby bylo možné ověřit účinnost testovaných metod a provádět jejich optimalizace, byly využity uměle připravené pseudovirionové částice odvozené od bakteriofága MS2 s unikátní vloženou sekvencí. Pro detekci byla použita reverzně transkripční polymerázová řetězová reakce probíhající v reálném čase. Tato metoda umožnila kvantifikaci virové nálože ve vzorku a tak stanovení účinnosti celého analytického postupu. Na základě výsledků a zkušeností byla vybrána metoda přímé organické flokulace jako nejvhodnější metoda izolace virových částic ze vzorků vod. Oproti ostatním metodám zde bylo možné opakovaně dosáhnout porovnatelných hodnot účinnosti. Metoda byla rovněž výhodná v jednoduchém a časově nenáročném provedení.
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
10606 - Microbiology
Result continuities
Project
—
Continuities
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Others
Publication year
2016
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů