On Simulating 3D Fluorescent Microscope Images
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F07%3A00022493" target="_blank" >RIV/00216224:14330/07:00022493 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
On Simulating 3D Fluorescent Microscope Images
Original language description
In recent years many various biomedical image segmentation methods have appeared. Though typically presented to be successful the majority of them was not properly tested against ground truth images. The obvious way of testing the quality of new segmentation was based on visual inspection by a specialist in the given field. The novel 3D biomedical image data simulator is presented in this paper. It offers the results of high quality. The evaluation of generated synthetic data is compared against real image data using standard similarity techniques.
Czech name
Simulace 3D fluorescenčních mikroskopických obrazových dat
Czech description
V posledních letech se objevila celá řada různých segmentačních technik vhodných pro biomedicínská obrazová data. Ačkoliv většina z těchto technik byla označována jako úspešných, jen málo jich bylo řádně testováno porovnáním výsledků s tzv. referečními daty. Většina z nich byla ověřena pouhým optickým porovnáním. V tomto článku je prezentován 3D simulátor schopný generovat syntetická data podobná těm, která jsou produkována při fluorescenční mikroskopii. Druhým neméně důležitým výstupem tohoto simulátoru jsou rovněž odpovídající referenční data vhodná právě k testování kvality libovolných segmentačních technik.
Classification
Type
D - Article in proceedings
CEP classification
JD - Use of computers, robotics and its application
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Article name in the collection
Computer Analysis of Images and Patterns
ISBN
978-3-540-74271-5
ISSN
—
e-ISSN
—
Number of pages
8
Pages from-to
309-316
Publisher name
Springer-Verlag
Place of publication
Berlin, Heidelberg
Event location
Vienna
Event date
Jan 1, 2007
Type of event by nationality
WRD - Celosvětová akce
UT code for WoS article
—