All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Acquiarium version 1.6

The result's identifiers

  • Result code in IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14330%2F08%3A00027695" target="_blank" >RIV/00216224:14330/08:00027695 - isvavai.cz</a>

  • Result on the web

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternative languages

  • Result language

    angličtina

  • Original language name

    Acquiarium version 1.6

  • Original language description

    Acquiarium 1.6 is free software for solving the common pipeline of many spatial cell studies using fluorescence microscopy. It addresses image capture, raw image correction, image segmentation, quantification of segmented objects and their spatial arrangement, volume rendering, and statistical evaluation. The software is designed for processing of a collection of many 3D images. It can be used for analysis of a collection of 2D images or time lapse series of 2D or 3D images as well. It has a modular design and is extensible via plug-ins.

  • Czech name

    Acquiarium verze 1.6

  • Czech description

    Acquiarium 1.6 je volně šiřitelný software pro provádění prostorových studií na buňkách pomocí fluorescenční mikroskopie. Software řeší snímání obrazu, korekce nasnímaných dat, segmentaci obrazu, kvantifikaci segmentovaných objektů a jejich prostorovéhorozložení, objemové vizualizace a statistické vyhodnocení. Software je navržen pro zpracování kolekce mnoha 3D obrazů. Může však být použit i pro analýzu kolekce 2D obrazů, nebo časových sérií 2D nebo 3D obrazů. Software je modulární a rozšiřitelný pomocí zásuvných modulů.

Classification

  • Type

    R - Software

  • CEP classification

    JD - Use of computers, robotics and its application

  • OECD FORD branch

Result continuities

  • Project

    <a href="/en/project/2B06052" target="_blank" >2B06052: Determination of markers, screening and early diagnostics of cancer diseases using highly automated processing of multidimensional biomedical images</a><br>

  • Continuities

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Others

  • Publication year

    2008

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data specific for result type

  • Internal product ID

    Acquiarium 1.6

  • Technical parameters

    free software distributed as binaries; written in C++ language, version 1.6

  • Economical parameters

  • Owner IČO

    00216224

  • Owner name

    Masarykova univerzita