Funkčný dopad variantu c.-140C>G v géne ANKRD26 a jeho úloha v rozvoji dedičnej trombocytopénie typu 2
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F24%3A00137826" target="_blank" >RIV/00216224:14740/24:00137826 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://sites.google.com/scientifika.eu/dna-diagnostika-2024" target="_blank" >https://sites.google.com/scientifika.eu/dna-diagnostika-2024</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Funkčný dopad variantu c.-140C>G v géne ANKRD26 a jeho úloha v rozvoji dedičnej trombocytopénie typu 2
Original language description
Dedičné trombocytopénie (IT) predstavujú heterogénnu skupinu ochorení, charakterizovanú zníženým počtom trombocytov. Niektoré typy IT sú spojené so zvýšeným rizikom rozvoja hematologických malignít, vrátane dedičnej trombocytopénie typu 2 (THC2). THC2 je zapríčinená patogénnymi zárodočnými variantmi v kritickom regióne 5΄ neprekladanej oblasti génu ANKDR26, vedúcimi k trvalej nadmernej expresii ANKRD26, výsledkom čoho je defekt v tvorbe trombocytov a následná trombocytopénia. Variant c.-140C>G, prítomný podľa dbSNP u 6,2% nefínskej európskej populácie, má rozpornú klinickú interpretáciu. Informácie z databázy ClinVar naznačujú pravdepodobne benígny/benígny charakter, publikované prípady však spájajú variant s THC2. Naša štúdia sa zaoberá analýzou funkčného dopadu variantu c.-140C>G v kombinácii s hodnotením klinických testov. Na základe výsledkov celogenómového sekvenovania boli vybratí jednotlivci s variantom c.-140C>G a reprezentatívna vzorka kontrolných jedincov bez variantu. U všetkých jedincov bola stanovená expresia génu ANKRD26 pomocou polymerázovej reťazovej reakcie v reálnom čase. Výsledky našej analýzy ukazujú, že expresia ANKRD26 v trombocytoch sa signifikantne nelíši medzi skupinou jedincov s c.-140C>G variantom a kontrolnou skupinou. Agregačné testy nepreukázali významné konzistentné zmeny funkcie trombocytov v závislosti na prítomnosti c.-140C>G variantu. Navyše, všetci jednotlivci s c.-140C>G variantom mali normálny počet trombocytov. Výsledky tejto štúdie poskytujú prvý funkčný dôkaz benígneho charakteru variantu c.-140C>G v 5΄ neprekladanej oblasti génu ANKDR26 v súvislosti s THC2. Potvrdenie benígneho charakteru má význam pre prognózu jednotlivcov diagnostikovaných s c.-140C>G variantom, najmä pokiaľ ide o vylúčenie zvýšeného rizika rozvoja hematologických malignít.
Czech name
—
Czech description
—
Classification
Type
O - Miscellaneous
CEP classification
—
OECD FORD branch
30205 - Hematology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/LX22NPO5102" target="_blank" >LX22NPO5102: National institute for cancer research</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2024
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů