BLAST Sequence Analyzer
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F14%3APR27856" target="_blank" >RIV/00216305:26220/14:PR27856 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty" target="_blank" >http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
BLAST Sequence Analyzer
Original language description
Software pro vizualizaci a úpravu sekvenovaných dat ve formátu *.scf. Program umožňuje načíst a porovnávat sekvenované nukleotidové sekvence z více běhů. Na základě těchto dat je sestavena konsensuální sekvence. Pomocí nástroje BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) jsou z databáze ncbi následně načteny sekvence, které jsou konsensu nejpodobnější. Uživatel má možnost prohlížet si interaktivně také flowgramy sekvenovaných dat. Na základě těchto informací může uživatel provádět editaci konsensuální sekvence. Výsledky editace včetně informací o nalezené BLAST sekvenci si poté může uživatel uložit ve formátu *.txt.
Czech name
BLAST Sequence Analyzer
Czech description
Software pro vizualizaci a úpravu sekvenovaných dat ve formátu *.scf. Program umožňuje načíst a porovnávat sekvenované nukleotidové sekvence z více běhů. Na základě těchto dat je sestavena konsensuální sekvence. Pomocí nástroje BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) jsou z databáze ncbi následně načteny sekvence, které jsou konsensu nejpodobnější. Uživatel má možnost prohlížet si interaktivně také flowgramy sekvenovaných dat. Na základě těchto informací může uživatel provádět editaci konsensuální sekvence. Výsledky editace včetně informací o nalezené BLAST sekvenci si poté může uživatel uložit ve formátu *.txt.
Classification
Type
R - Software
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GAP102%2F11%2F1068" target="_blank" >GAP102/11/1068: Nano-Electro-Bio-Tools for Biochemical and Molecularly-Biological Studies of Eukaryotic Cells (NanoBioTECell)</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2014
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
BLAST Sequence Analyzer
Technical parameters
Software byl realizován jako výsledek projektu GAČR Nano-elektro-bio-nástroje pro biochemické a molekulárně-biologické studie eukaryotických buněk (NanoBioTECell). Produkt je využíván na VUT v Brně a na Mendelově univerzitě, Ústav chemie a biochemie. Kompilátor Matlab Compiler s Visual C++. Pro spuštění programu je zapotřebí MCRrunTime knihovna. Software je volně stažitelný na adrese http://www.dbme.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty.
Economical parameters
50.000 Kč
Owner IČO
00216305
Owner name
Ústav biomedicínského inženýrství