pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences

Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26230%2F16%3APR28895" target="_blank" >RIV/00216305:26230/16:PR28895 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html" target="_blank" >http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/pqsfinder.html</a>
DOI - Digital Object Identifier
—

Result language
angličtina
Original language name
pqsfinder: an R/Bioconductor package for identification of potential quadruplex forming sequences
Original language description
The main functionality of the this package is to detect DNA sequence patterns that are likely to fold into an intramolecular G-quadruplex (G4). Unlike many other approaches, this package is able to detect sequences responsible for G4s folded from imperfect G-runs containing bulges or mismatches and as such is more sensitive than competing algorithms.
Czech name
—
Czech description
—

Publication year
2016
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID
pqsfinder
Technical parameters
Volně šiřitelný software poskytovaný pod licencí BSD (přesné znění licence je dostupné na stránce http://www.opensource.org/licenses/bsd-license.php).Pro informace o licenčních podmínkách prosím kontaktujte: Mgr. Radka Báčová, Výzkumné centrum informačních technologií, Fakulta informačních technologií VUT v Brně, Božetěchova 2, 612 66 Brno, 541 141 473.
Economical parameters
Volně šiřitelný software poskytovaný pod licencí BSD.
Owner IČO
—
Owner name
Fakulta informačních technologií

Similar results(10)