Real-time PCR detection of Blackcurrant reversion virus (BRV) and Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV) in biological material
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F20%3AN0000048" target="_blank" >RIV/25271121:_____/20:N0000048 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Real-time PCR detekce virů Blackcurrant reversion virus (BRV) a Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV) v biologickém materiálu
Original language description
Metodika se zaměřuje na zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů Blackcurrant reversion virus (BRV) a Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV), které jsou původci virového onemocnění rybízu (Ribes spp.). BRV je původcem virového zvratu rybízu a GVBaV je původcem virového světlezeleného lemování žilek rybízu. Hostitelskými rostlinami těchto virů jsou zejména rybízy, avšak BRV byl popsán také u dalších příbuzných druhů. Virus GVBaV byl nalezen u angreštu (Ribes uva-crispa). Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci obou virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu EPPO PM7/98(4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu, dále pak pro využití ve virologických laboratořích v základním či aplikovaném výzkumu.
Czech name
Real-time PCR detekce virů Blackcurrant reversion virus (BRV) a Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV) v biologickém materiálu
Czech description
Metodika se zaměřuje na zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů Blackcurrant reversion virus (BRV) a Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV), které jsou původci virového onemocnění rybízu (Ribes spp.). BRV je původcem virového zvratu rybízu a GVBaV je původcem virového světlezeleného lemování žilek rybízu. Hostitelskými rostlinami těchto virů jsou zejména rybízy, avšak BRV byl popsán také u dalších příbuzných druhů. Virus GVBaV byl nalezen u angreštu (Ribes uva-crispa). Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci obou virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu EPPO PM7/98(4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu, dále pak pro využití ve virologických laboratořích v základním či aplikovaném výzkumu.
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TJ02000159" target="_blank" >TJ02000159: Development and validation of kits for diagnostics of selected plant viruses</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2020
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
978-80-87030-74-5
Regulation ID
UKZUZ 205304/2020
Technical parameters
Osvědčení pod č.j. UKZUZ 205304/2020 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ.
Economical parameters
Metodika zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje diagnostiku virů BRV a GVBaV. Díky tomu mohou laboratoře zpracovat s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, což např. sníží náklady na jednu analýzu, zvýší příjem z diagnostické činnosti nebo uvolní kapacitu laboratoře pro další testy. Rychlá odezva laboratoře bude mít pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o vyšetření zdravotního stavu plodin, neboť může získat výsledky v kratším čase, a tak rychleji reagovat na výsledky. Záleží také na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře provádějící testy. Pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i ztrátám na výnosu v dalších letech.
Certification body designation
Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů