Real-time PCR detection of black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot virus (SLRSV) in biological material
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F22%3AN0000057" target="_blank" >RIV/25271121:_____/22:N0000057 - isvavai.cz</a>
Result on the web
<a href="https://www.vsuo.cz/images/patenty/Valentov_Metodika-RubusVir_2022.pdf" target="_blank" >https://www.vsuo.cz/images/patenty/Valentov_Metodika-RubusVir_2022.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
čeština
Original language name
Real-time PCR detekce virů black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot (SLRSV) v rostlinném materiálu
Original language description
Cílem metodiky je poskytnout nový detekční systém pro rutinní diagnostiku rostlinných virů black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot virus (SLRSV), původců virových onemocnění u rostlin rodu Rubus. Navržená metodika detekce virů je založena na principu multiplexní real-time PCR a umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci všech čtyř virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu obsaženého v EPPO PM 7/98 (5) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu. Součástí metodiky je i porovnání diagnostických metod ELISA a nového detekčního systému pro viry RpRSV, RBDV a SLRSV, pro které jsou ELISA soupravy komerčně dostupné. Pro tyto viry lze diagnostický systém použít pro konfirmaci nálezů získaných metodou ELISA.
Czech name
Real-time PCR detekce virů black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot (SLRSV) v rostlinném materiálu
Czech description
—
Classification
Type
N<sub>metC</sub> - Methodology certified by the authorised body
CEP classification
—
OECD FORD branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
Result continuities
Project
<a href="/en/project/TO01000295" target="_blank" >TO01000295: Healthy berries in a changing climate: development of new biotechnological procedures for virus diagnostics, vector studies, elimination and safe preservation of strawberry and raspberry</a><br>
Continuities
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Others
Publication year
2022
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Internal product ID
ISBN 978-80-87030-87-5
Regulation ID
UKZUZ 219681/2022
Technical parameters
Osvědčení pod č. UKZUZ 219681/2022 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ.
Economical parameters
Metodika zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje diagnostiku virů BRNV, RpRSV, RBDV a SLRSV. Díky tomu mohou laboratoře zpracovat s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, což např. sníží náklady na jednu analýzu, zvýší příjem z diagnostické činnosti nebo uvolní kapacitu laboratoře pro další testy. Rychlá odezva laboratoře bude mít pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o vyšetření zdravotního stavu plodin, neboť může získat výsledky v kratším čase, a tak rychleji reagovat na výsledky. Záleží také na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře provádějící testy. Pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i ztrátám na výnosu v dalších letech.
Certification body designation
Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno
Date of certification
—
Method of use
C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů