Random amplified polymorphic DNA (RAPD) and simple sequence repeat (SSR) marker efficacy for maize hybrid identification

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26296080%3A_____%2F11%3A%230000313" target="_blank" >RIV/26296080:_____/11:#0000313 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Identifikace hybridů kukuřice s využitím molekulárních technik RAPD a SSR

Original language description

Abstrakt Důležitou součástí šlechtitelského procesu je detailní znalost genetické diversity a vztahů mezi hybridy kukuřice. Hlavním cílem bylo (1) s využitím RAPD a SSR markerů odhadnout genetickou diverzitu mezi 30 hybridy kukuřice a (2) porovnat genetické hodnoty získané z těchto markrovacích systémů. Byl hodnocen soubor 30 hybridů kukuřice. Z důvodu srovnání dvou odlišných metod byly spočítány genetické parametry, tj. počet polymorfních bandů, průměrný počet alel na lokus, efektivní počet alel na lokus (Ne), očekávaná heterozygotnost (H), index účinnosti a polymorfní informační obsah (PIC). Lepší výsledky byly dosaženy v případě SSR markerů. SSR systém poskytl průměrnú hodnotu PIC 0,71 (v rozsahu od 0,47 do 0,91), v případě RAPD byla průměrná hodnota 0,61 (v rozsahu od 0,44 do 0,82). Genetická podobnost (GS) byla pro SSR vypočtena pomocí koeficientu Nei&Li, v případě RAPD byl použit podobnostní koeficient Jaccard. Pro SSR systém se hodnota GS pohybovala v rozmezí od 26,3% do 88,5% (

Czech name

Identifikace hybridů kukuřice s využitím molekulárních technik RAPD a SSR

Czech description

Abstrakt Důležitou součástí šlechtitelského procesu je detailní znalost genetické diversity a vztahů mezi hybridy kukuřice. Hlavním cílem bylo (1) s využitím RAPD a SSR markerů odhadnout genetickou diverzitu mezi 30 hybridy kukuřice a (2) porovnat genetické hodnoty získané z těchto markrovacích systémů. Byl hodnocen soubor 30 hybridů kukuřice. Z důvodu srovnání dvou odlišných metod byly spočítány genetické parametry, tj. počet polymorfních bandů, průměrný počet alel na lokus, efektivní počet alel na lokus (Ne), očekávaná heterozygotnost (H), index účinnosti a polymorfní informační obsah (PIC). Lepší výsledky byly dosaženy v případě SSR markerů. SSR systém poskytl průměrnú hodnotu PIC 0,71 (v rozsahu od 0,47 do 0,91), v případě RAPD byla průměrná hodnota 0,61 (v rozsahu od 0,44 do 0,82). Genetická podobnost (GS) byla pro SSR vypočtena pomocí koeficientu Nei&Li, v případě RAPD byl použit podobnostní koeficient Jaccard. Pro SSR systém se hodnota GS pohybovala v rozmezí od 26,3% do 88,5% (

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2011

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

African Journal of Biotechnology

ISSN

1684-5315

e-ISSN

—

Volume of the periodical

24

Issue of the periodical within the volume

10

Country of publishing house

NE - THE FEDERAL REPUBLIC OF NIGERIA

Number of pages

8

Pages from-to

4797-4801

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—