Current situation of the art of liquid biopsies: technology, clinical significance and numbers

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26475821%3A_____%2F16%3AN0000028" target="_blank" >RIV/26475821:_____/16:N0000028 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Současný stav v oblasti tekutých biopsií: technologie, klinický význam a hra čísel

Original language description

Prezentace na celostátní konferenci Dny molekulární patologie (Olomouc, 2016): Metodika molekulárního profilování volné nádorové DNA (cell-free tumor DNA, ctDNA), pro kterou se v posledních letech vžilo malebné označení tekutá biopsie (liquid biopsy), prošla dlouhým obdobím technologického vývoje. Od prvních zpráv o prosté detekci zvýšených hladin cirkulující DNA v krvi onkologických pacientů až po přechod k detekci ctDNA na základě záchytu nádorové specifických somatických mutací bylo společným jmenovatelem hledání vhodných metodických přístupů tak především i smysluplného využití tohoto postupu v klinické praxi. Z dnešního pohledu lze metodiky používané pro tekutou bipsii rozdělit na tzv. analogové a digitání. Postupy označované jako analogové bývají často založeny na formátu kvantitativní PCR (qPCR) v různých obměnách konkrétního provedení. Mezi nejznámější patří metody založené na alelicky-specifické PCR známé pod zkratkou ARMS (amplification-refractory mutation system), případně metody využívající amplifikaci s obohacením mutantní frakce na základě rozdílného stupně denaturace v průběhu templotního cyklování (Improved and Complete Enrichment CO-amplification at Lower Denaturation temperature, ICE-COLD). Společně s těmito se v poslední době stále více prosazují tzv. digitální přístupy, mezi které patří digitální PCR a hluboké sekvenování nové generace (deep next-generation sequencing, deep NGS).

Czech name

Současný stav v oblasti tekutých biopsií: technologie, klinický význam a hra čísel

Czech description

Prezentace na celostátní konferenci Dny molekulární patologie (Olomouc, 2016): Metodika molekulárního profilování volné nádorové DNA (cell-free tumor DNA, ctDNA), pro kterou se v posledních letech vžilo malebné označení tekutá biopsie (liquid biopsy), prošla dlouhým obdobím technologického vývoje. Od prvních zpráv o prosté detekci zvýšených hladin cirkulující DNA v krvi onkologických pacientů až po přechod k detekci ctDNA na základě záchytu nádorové specifických somatických mutací bylo společným jmenovatelem hledání vhodných metodických přístupů tak především i smysluplného využití tohoto postupu v klinické praxi. Z dnešního pohledu lze metodiky používané pro tekutou bipsii rozdělit na tzv. analogové a digitání. Postupy označované jako analogové bývají často založeny na formátu kvantitativní PCR (qPCR) v různých obměnách konkrétního provedení. Mezi nejznámější patří metody založené na alelicky-specifické PCR známé pod zkratkou ARMS (amplification-refractory mutation system), případně metody využívající amplifikaci s obohacením mutantní frakce na základě rozdílného stupně denaturace v průběhu templotního cyklování (Improved and Complete Enrichment CO-amplification at Lower Denaturation temperature, ICE-COLD). Společně s těmito se v poslední době stále více prosazují tzv. digitální přístupy, mezi které patří digitální PCR a hluboké sekvenování nové generace (deep next-generation sequencing, deep NGS).

Type

A - Audiovisual production

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/NV15-27939A" target="_blank" >NV15-27939A: Benefit of new "liquid biopsy" technology for monitoring of complex treatment of colorectal carcinoma in stage 3 and 4.</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2016

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

ISBN

—

Place of publication

Olomouc, CR

Publisher/client name

—

Version

—

Carrier ID

—