Application of MALDI-TOF MS for the identification of bacteria causing spoilage of dairy products

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26722861%3A_____%2F18%3AN0000065" target="_blank" >RIV/26722861:_____/18:N0000065 - isvavai.cz</a>

Alternative codes found

RIV/60461373:22330/18:43917529 RIV/60461373:22810/18:43917529

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

čeština

Original language name

Využití MALDI-TOF MS pro identifikaci bakterií způsobujících kažení mlékárenských výrobků

Original language description

Metoda MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry, hmotnostní spektrometrie proteinů pomocí laserové desorpce/ionizace za účasti matrice s analyzátorem doby průletu) je rychlou a moderní metodou identifikace mikroorganismů, zvláště pak bakterií. V této práci byla provedena MALDI-TOF MS identifikace celkem 711 bakteriálních izolátů z mlékárenských výrobků a provozoven. Celkem 91 % izolátů bylo spolehlivě identifikováno na alespoň rodové úrovni. Úroveň spolehlivosti rodové a druhové identifikace ovlivňuje nejen výběr vhodné metody přípravy vzorku pro danou taxonomickou skupinu, ale i fylogenetické vztahy v rámci rodů a přítomnost odpovídajících proteinových profilů v referenční databázi. Druhová identifikace je poté více náročná pro jednotlivé druhy druhových skupin (např. Bacillus cereus group, Enterobacter cloacae komplex, druhové skupiny Pseudomonas spp.). Bylo zjištěno, že databáze Biotyper 3.1 (Bruker Daltonics, Německo) rodově i druhově dostatečně pokrývá běžnou bakteriální mikroflóru mlékárenských výrobků, kdy s využitím této databáze byly metodou MALDI-TOF MS identifikovány bakteriální izoláty patřící do celkem 39 rodů.

Czech name

Využití MALDI-TOF MS pro identifikaci bakterií způsobujících kažení mlékárenských výrobků

Czech description

Metoda MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry, hmotnostní spektrometrie proteinů pomocí laserové desorpce/ionizace za účasti matrice s analyzátorem doby průletu) je rychlou a moderní metodou identifikace mikroorganismů, zvláště pak bakterií. V této práci byla provedena MALDI-TOF MS identifikace celkem 711 bakteriálních izolátů z mlékárenských výrobků a provozoven. Celkem 91 % izolátů bylo spolehlivě identifikováno na alespoň rodové úrovni. Úroveň spolehlivosti rodové a druhové identifikace ovlivňuje nejen výběr vhodné metody přípravy vzorku pro danou taxonomickou skupinu, ale i fylogenetické vztahy v rámci rodů a přítomnost odpovídajících proteinových profilů v referenční databázi. Druhová identifikace je poté více náročná pro jednotlivé druhy druhových skupin (např. Bacillus cereus group, Enterobacter cloacae komplex, druhové skupiny Pseudomonas spp.). Bylo zjištěno, že databáze Biotyper 3.1 (Bruker Daltonics, Německo) rodově i druhově dostatečně pokrývá běžnou bakteriální mikroflóru mlékárenských výrobků, kdy s využitím této databáze byly metodou MALDI-TOF MS identifikovány bakteriální izoláty patřící do celkem 39 rodů.

Type

J_ost - Miscellaneous article in a specialist periodical

CEP classification

—

OECD FORD branch

10606 - Microbiology

Project

<a href="/en/project/QJ1210300" target="_blank" >QJ1210300: Protection systems of quality and safety of dairy products by means of suitable methods applicable in practice</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Publication year

2018

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Mlékařské listy – zpravodaj

ISSN

1212-950X

e-ISSN

—

Volume of the periodical

29

Issue of the periodical within the volume

6

Country of publishing house

CZ - CZECH REPUBLIC

Number of pages

7

Pages from-to

25-31

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—