Cytos: Simulator of Morphogenetic Systems

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F47813059%3A19240%2F19%3AA0000502" target="_blank" >RIV/47813059:19240/19:A0000502 - isvavai.cz</a>

Result on the web

<a href="http://sosik.zam.slu.cz/msystem/" target="_blank" >http://sosik.zam.slu.cz/msystem/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Cytos: Simulator of Morphogenetic Systems

Original language description

Morphogenetic system (M system) introduced in 2016 is a new abstract model of growth of organisms, interacting with and “sensing” its physical environment, so as to be capable of self-modification and unenthropical evolution. It is motivated by key aspects of morphogenetic phenomena such as self-assembly, homeostasis, self-reproduction and self-healing of evolving systems. The CYTOS software package implements M systems in silico. It consists of two modules, an original simulation engine and a 3D visualization tool. It is intended for experimental modelling of the phenomena mentioned above, as well as for applications in biological modeling of morphogenetic processes.

Czech name

—

Czech description

—

Type

R - Software

CEP classification

—

OECD FORD branch

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Project

<a href="/en/project/LQ1602" target="_blank" >LQ1602: IT4Innovations excellence in science</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2019

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Internal product ID

Cytos

Technical parameters

Simulační stroj Cytos pracuje v diskrétním čase a spojitém 3D prostoru, kombinuje náhodné interakce a pohyb velkého množství částic s principy morfogenetického růstu, který je těmito interakcemi kontrolován. Jedná se o originální a nově vyvinuté techniky morfogenetického modelování. Aktuální verze je napsána v C#, připravuje se její masívní paralelizace pro běh na mnohajádrových strojích. Vizualizační modul je připraven s využitím herního stroje Unity, doplněného o originální kódy interagující s vlastním simulátorem.

Economical parameters

Jde o software pro výzkumné účely, volně šiřitelný. Přímý ekonomický dopad lze tudíž obtížně odhadnout, nicméně o zájmu o jeho výzkumné aplikace svědčí fakt, že je o něm již referováno na dvou zvaných přednáškách na mezinárodních konferencích (CMC20, Rumunsko, 2019 a plánovaná NCMA 2020, Vídeň, Rakousko).

Owner IČO

47813059

Owner name

Slezská univerzita v Opavě