Evaluation of parentage testing in the Czech population of Holstein cattle
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12220%2F06%3A00007169" target="_blank" >RIV/60076658:12220/06:00007169 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Evaluation of parentage testing in the Czech population of Holstein cattle
Original language description
A set of 233 of Holstein calves, their 233 dams and 44 sires from 4 large sized herds was genotyped for 10 microsatellies recommended by ISAG for paternity / parentage testing. Heterozygosity of microsatellites ranged from 0.607 (SPS115) to 0.835 (TGLA227), and PIC from 0.575 (SPS115) to 0.816 (TGLA227) confirming high polymorphism of each analysed locus. Their combined exclusion probability reached 0.999, which made them suitable and sufficiently accurate for parentage testing. Conflict between putative parents and calf in at least 2 markers with combined exclusion probability >0.9 was required to reject parentage. The pedigree was considered incorrect in 25 (10.73%) of evaluated progeny/parents trios, of which in 10 samples the genotype of both parents didn't match their offspring, and in 2 samples putative dam was in conflict with calf genotype. This result shows, that the interchange of calves at farms with large herd sizes plays as much important role as the errors in sire identif
Czech name
Hodnocení testů parentity v české populaci holštýnského skotu
Czech description
Vzorek 233 holštýnských telat, jejich 233 matek a 44 otců ze 4 velkokapacitních chovů byl genotypizován v 10 mikrosatelitech doporučených organizací ISAG k testování paternity / parentity. Vysoký polymorfismus všech lokusů ukazovaly hodnoty heterozygotnosti, která kolísala mezi 0,607 (SPS115) a 0,835 (TGLA227), a PIC, který se pohyboval od 0,575 (SPS115) do 0,816 (TGLA227). Jejich využitelnost a vysokou spolehlivost potvrdila kombinovaná pravděpodobnost vyloučení, která dosáhla hodnoty 0,999. Zamítnutípůvodu bylo založeno na konflikt nejméně ve 2 markerech mezi předpokládanými rodiči a potomkem a kombinované pravděpodobnosti vyloučení > 0,9. Tuto podmínku v analyzovaném vzorku splňovalo 25 (10,37%) trojic, ze kterých v 10 případech neodpovídal genotyppotomka ani jednomu z rodičů a ve dvou případech byl genotyp potomka v rozporu s genotypem matky. Zjištěné výsledky ukázaly, že ve velkokapacitních chovech hraje záměna telat stejně důležitou roli jako chyby v identifikaci otce nebo v in
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
—
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2006
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Czech Journal of Animal Science : Živočišná výroba
ISSN
1212-1819
e-ISSN
—
Volume of the periodical
51
Issue of the periodical within the volume
12
Country of publishing house
CZ - CZECH REPUBLIC
Number of pages
7
Pages from-to
503-509
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—