Case study of combinatorial imaging: What protocol and what chlorophyll fluorescence image to use when visualizing infection of Arabidopsis thaliana by Pseudomonas syringae?

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12640%2F06%3A00006791" target="_blank" >RIV/60076658:12640/06:00006791 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Case study of combinatorial imaging: What protocol and what chlorophyll fluorescence image to use when visualizing infection of Arabidopsis thaliana by Pseudomonas syringae?

Original language description

Localized infection of a plant can be mapped by a sequence of images capturing chlorophyll fluorescence transients in actinic light. Choice of the actinic light protocol co-determines fluorescence contrast between infected leaf segment and surrounding healthy tissue. Frequently, biology cannot predict with which irradiance protocol, in which fluorescence image of the sequence, and in which segment of the image there will be the highest contrast between the healthy and infected tissue. Here, we introducea new technique that can be applied to identify the combination of chlorophyll fluorescence images yielding the highest contrast. The sets of the most contrasting images vary throughout the progress of the infection. Such specific image sets, stress-revealing fluorescence signatures, can be found for the initial and late phases of the infection. Using these signatures, images can be divided into segments that show tissue in different infection phases. We demonstrate the capacity of the

Czech name

Kombinatorické zobrazování: Jaký protokol a které chlorofylové fluorescenční obrazy použít pro vizualizaci infekce arabidopsis thaliana bakterií pseudomonas syringae.

Czech description

V publikaci popisujeme problematiku detekce infekce arabidopsis thaliana bakterií pseudomonas syringae pomocí zobrazovací chlorofylové fluorometrie. Porovnáváme výhody a možnosti konvenčního přístupu a metody nazvané kombinatorické zobrazování. Kombinatorické zobrazování využívá výhod metod selekce příznaků a klasifikace a umožňuje detekovat infekci výrazně dříve než konvenčním přístupem. Výhody tohoto přístupu jsou demonstrovány na schopnostech detekovat infekci na listech rostlin, detekovat její fázia schopnosti ohodnotit informační přínos jednotlivých částí měřícího protokolu.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

BO - Biophysics

OECD FORD branch

—

Project

—

Continuities

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Photosynthesis Research

ISSN

0166-8595

e-ISSN

—

Volume of the periodical

90

Issue of the periodical within the volume

3

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

11

Pages from-to

243-253

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—