Screening for microbial markers in Miocene sediment exposed during open-cast brown coal mining

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F06%3A00040257" target="_blank" >RIV/60077344:_____/06:00040257 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Screening for microbial markers in Miocene sediment exposed during open-cast brown coal mining

Original language description

Viable microorganisms were found in Miocene lacustrine clays of the cypris formation excavated from 200-m below the surface as spoil during open-cast brown coal mining (Sokolov Brown Coal Basin, North-Western Bohemia, Czech Republic). Both saprotrophic microfungi of the genera Penicillium, Verticillium, Cladosporium, Aspergillus as well as heterotrophic bacteria were isolated from an intact sediment cores. Heterotrophic bacteria were classified by the MIS Sherlock System as representatives of genera Nocardiopsis, Arthrobacter, Micrococcus, Kocuria, Rothia, Clavibacter, Bacillus, Paenibacillus, Brevibacillus, Microbacterium, Acinetobacter, Pseudomonas. A bacterium found among the strains had an atypical fatty acids profile enriched by branched fatty acids and polyunsaturated fatty acid (18:3w6) and gave no MIS Sherlock match. Phospholipid fatty acids analysis indicates a relatively high (535 pmol.g-1) but inhomogeneously distributed viable microbial biomass.

Czech name

Vyhledávání mikrobiálních markerů v miocénním sedimentu odkrytém během povrchové těžby hnědého uhlí

Czech description

Během těžby hnědého uhlí (Sokolovská hnědouhelná pánev, severozápadní Čechy, Česká republika) v hloubce 200 m pod povrchem v odkrytých miocénních jezerních jílech cyprisové formace byly nalezeny životaschopné mikroorganismy. Z intaktních jader sedimentubyly izolovány saprotrofní mikroskopické houby rodu Penicillium, Verticillium, Cladosporium, Aspergillus i heterotrofní bakterie. Heterotrofní bakterie byly klasifikovány pomocí metody MIS Sherlock System jako zástupci rodů Nocardiopsis, Arthrobacter, Micrococcus, Kocuria, Rothia, Clavibacter, Bacillus, Paenibacillus, Brevibacillus, Microbacterium, Acinetobacter, Pseudomonas. Jeden z nalezených bakteriálních kmenů se vyznačoval atypickým profilem mastných kyselin obohacených větvenými kyselinami a polynenasycenou kyselinou (18:3w6), nebyl pomocí MIS metody klasifikován. Analýza fosfolipidických mastných kyselin indikovala relativně vysoký (535 pmol.g-1), ale nehomogenní výskyt živé mikrobiální biomasy.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EH - Ecology - communities

OECD FORD branch

—

Project

Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2006

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

Antonie van Leeuwenhoek International Journal of General and Molecular Microbiology and Antonie van Leeuwenhoek Journal of Microbiology

ISSN

0003-6072

e-ISSN

—

Volume of the periodical

89

Issue of the periodical within the volume

3-4

Country of publishing house

NL - THE KINGDOM OF THE NETHERLANDS

Number of pages

5

Pages from-to

459-463

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—