The 2?-O-ribose methyltransferase for cap 1 of spliced leader RNA and U1 small nuclear RNA in Trypanosoma brucei
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F07%3A00091123" target="_blank" >RIV/60077344:_____/07:00091123 - isvavai.cz</a>
Alternative codes found
RIV/60076658:12310/07:00008004
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
The 2?-O-ribose methyltransferase for cap 1 of spliced leader RNA and U1 small nuclear RNA in Trypanosoma brucei
Original language description
The function of cap 1 2'-O-ribose methylation is not known in any eukaryotic system, although it is a conserved modification. In kinetoplastid flagellates trans-splicing of spliced leader (SL) to polycistronic precursors conveys the hypermethylated cap 4to all nuclear messenger RNAs. We report the first eukaryotic cap 1 2'-O-ribose methyltransferase, TbMTr1, a member of a conserved family of viral and eukaryotic enzymes. Recombinant TbMTr1 methylates the ribose of the first nucleotide of a m7G-capped substrate. Knockdowns and knockouts of TbMTr1 in Trypanosoma brucei grow normally, while displaying loss of 2'-O-ribose methylation at cap 1 on SL and U1 snRNA. TbMTr1 knockouts have an accumulation of cap 0 substrate, however spliced messenger RNA is modified at position 4 and lacks 2'-O-ribose methylation at position 1. Accumulation of 3'-extended SL indicates a delay in processing, and suggests a synergistic role for cap 1 in maturation of substrate SL RNA.
Czech name
2?-O-ribose methyltransferáza pro čepičku 1 spliced leader RNA a U1 malé jaderné RNA v Trypanosoma brucei
Czech description
Dosud není známa funkce 2?-O-ribozové metylace v čepičce typu 1 u žádného eukaryota, ačkoli se jedná o vysoce konzervovanou medifikaci. Díky sestřihu formou trans z polycistronických prekurzorů prostřednictvím spliced leader (SL) dochází u kinetoplastidových bičíkovců k přenosu hypermetylované čepičky typu 4 na všechny jaderné poslíčkové RNA. V této práci jsme charakterizovali jako první eukaryotickou čepičkovou 2?-O-ribozovou metyltransferázu TbMtr1, která je členem konzervované rodiny virových a eukaryotických enzymů. Knockdownové a knockoutové linie Trypanosoma brucei pro gen TbMTr1 rostou normálně, ačkoli se u nich nachází ztráta 2?-O-ribozové metylace na čepičce typu 1 u SL a U1 malých jaderných RNA. U knockoutové linie pro TbMTr1 došlo k akumulaci substrátu čepičky O, ačkoli je sestřihaná poslíčková RNA modifikována v pozici 4 a postrádá metylaci 2?-O-ribozy v pozici 1.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
Result was created during the realization of more than one project. More information in the Projects tab.
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2007
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
Molecular and Cellular Biology
ISSN
0270-7306
e-ISSN
—
Volume of the periodical
27
Issue of the periodical within the volume
17
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
9
Pages from-to
6084-6092
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—