Cytogenetic characterization and AFLP-based genetic linkage mapping for the butterfly Bicyclus anynana, covering all 28 karyotyped chromosomes
The result's identifiers
Result code in IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F08%3A00316591" target="_blank" >RIV/60077344:_____/08:00316591 - isvavai.cz</a>
Result on the web
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternative languages
Result language
angličtina
Original language name
Cytogenetic characterization and AFLP-based genetic linkage mapping for the butterfly Bicyclus anynana, covering all 28 karyotyped chromosomes
Original language description
Physical genomic features in the butterfly Bicyclus anynana were examined by karyotype analysis and construction of a linkage map. Unlike other Lepidoptera, the sex-chromosome WZ-bivalent in B. anynana consists of an abnormally small, heterochromatic W-chromosome with the Z-chromosome wrapped around it. This suggests an intermediate stage in the process of secondary loss of the W-chromosome to a ZZ/Z sex determination system. Chromosome counts confirmed a haploid number of n = 28. The linkage map was constructed using a novel approach that uses JOINMAP-software for Lepidoptera linkage mapping. A total of 347 AFLP markers, 9 microsatellites and one single-copy nuclear gene covered all 28 chromosomes, with a mapping distance of 1354 cM. Conserved syntenyof Tpi on the Z-chromosome was confirmed for B. anynana. This study provides an insight in Lepidoptera sex chromosome evolution and it proposes a simpler and more reliable method of linkage mapping than used for Lepidoptera to date.
Czech name
Cytogenetická charakterizace a genetické vazbové mapování pomocí AFLP u motýla Bicyclus anynana, zahrnující všech 28 chromosomů jeho karyotypu
Czech description
Fyzické parametry genomu motýla Bicyclus anynana byly zkoumány analýzou karyotypu a konstrukcí vazbové mapy. Na rozdíl od jiných motýlů, pohlavní bivalent WZ je u B. anynana tvořen abnormálně malým, heterochromatinovým chromosomem W, okolo kterého je obtočen chromosom Z. Tato konstituce indikuje intermediární stádium procesu sekundární ztráty chromosomu W směrem k systému determinace pohlaví typu ZZ/Z. Analýza karyotypu potvrdila haploidní počet chromosomů n = 28. Vazbová mapa byla konstruována pomocí nové strategie využívající software JOINMAP, specifický pro vazbové mapování motýlů. Pro zmapování všech 28 chromosomů o celkové mapovací délce 1354 cM bylo využito 347 markerů AFLP, 9 mikrosatelitů a jeden jaderný gen. Dále byla prokázána zachovaná syntenie genu Tpi, lokalizovaného na chromosomu Z. Tato studie přispívá k pochopení evoluce pohlavních chromosomů motýlů a poskytuje jednodušší a věrohodnější metodu pro vazbové mapování než metody dosud u motýlů používané.
Classification
Type
J<sub>x</sub> - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)
CEP classification
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD branch
—
Result continuities
Project
<a href="/en/project/GA206%2F06%2F1860" target="_blank" >GA206/06/1860: Molecular evolution of sex chromosomes in Lepidoptera</a><br>
Continuities
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Others
Publication year
2008
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data specific for result type
Name of the periodical
PLoS ONE
ISSN
1932-6203
e-ISSN
—
Volume of the periodical
3
Issue of the periodical within the volume
12
Country of publishing house
US - UNITED STATES
Number of pages
12
Pages from-to
—
UT code for WoS article
—
EID of the result in the Scopus database
—