Evolutionary origins and functions of the carotenoid biosynthetic pathway in marine diatoms

Result code in IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F08%3A00318025" target="_blank" >RIV/60077344:_____/08:00318025 - isvavai.cz</a>

Result on the web

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Result language

angličtina

Original language name

Evolutionary origins and functions of the carotenoid biosynthetic pathway in marine diatoms

Original language description

Carotenoids are produced by photosynthetic organisms, where they play essential roles in light harvesting and photoprotection. The carotenoid biosynthetic pathway of diatoms is largely unstudied, but is of particular interest because these organisms havea different evolutionary history with respect to the Plantae and are thought to be derived from an ancient secondary endosymbiosis between heterotrophic and autotrophic eukaryotes. Furthermore, diatoms have an additional xanthophyll-based cycle for dissipating excess light energy with respect to green algae and higher plants. To explore the origins and functions of the carotenoid pathway in diatoms we searched for genes encoding pathway components in the recently completed genome sequences of two marine diatoms. Consistent with the supplemental xanthophyll cycle in diatoms, we found more copies of the genes encoding violaxanthin de-epoxidase (VDE) and zeaxanthin epoxidase (ZEP) enzymes compared with other photosynthetic eukaryotes.

Czech name

Evoluční původ a funkce dráhy pro syntézu karotenoidů u mořských rozsivek

Czech description

Karotenoidy jsou produkovány všemi fotosyntetickými organismy. Hraji zde zásadní roli při fotosyntéze a ochraně proti nežádoucím účinkům světla. Metabolická dráha pro syntézu karotenoidů je potenciálně velmi zajímavá, protože rozsivky mají jinou evolučníhistorii, než rostliny. Jejich plastid totiž pochází ze sekundární endosymbiózy a nikoliv z primární, jako rostlinné plastidy. Rozsivky používají, vzhledem k rostlinám, další tzv. xantofylový cyklus. Abychom mohli prozkoumat syntézu karotenoidů u rozsivek, vyhledali jsme příslušné geny v genomech rozsivek Thalassiosira pseudonana a Phaeodactylum tricornutum a podrobili je fylogenetické analýze. Našli jsme více genů kódujících violaxantin de-epoxidase (VDE) a zeaxantin epoxidase (ZEP), než u rostlin.

Type

J_x - Unclassified - Peer-reviewed scientific article (Jimp, Jsc and Jost)

CEP classification

EB - Genetics and molecular biology

OECD FORD branch

—

Project

<a href="/en/project/IAA500220502" target="_blank" >IAA500220502: Evolution of metabolic pathways in complex plastid of the diatom Thalassiosira pseudonana</a><br>

Continuities

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Publication year

2008

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Name of the periodical

PLoS ONE

ISSN

1932-6203

e-ISSN

—

Volume of the periodical

3

Issue of the periodical within the volume

8

Country of publishing house

US - UNITED STATES

Number of pages

16

Pages from-to

—

UT code for WoS article

—

EID of the result in the Scopus database

—